PubMed :生物医学方面的论文搜寻引擎

更新时间:2023-04-19 17:01

Pubmed是一个检索全世界生物医学期刊论文的免费搜索引擎,由美国国家医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)所属的美国国家生物技术信息中心(National Center for 生物技术 Information,NCBI)开发并维护,使用NCBI的Entrez检索平台。自1997年6月26日起,PubMed系统向公众免费提供。

PubMed(PubMed=Public+药品)这一名称,源自“Public”和 “Medline”两个英语单词,意味着面向公众的、免费的医药信息检索服务。PubMed是美国国家医学图书馆最重要的书目文摘数据库,覆盖了全世界80多个国家和地区的5000余种生物医学期刊的摘要和部分全文,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。PubMed数据库收录的文献75%-85%为英语,70%-80%的文献有著者撰写的英文摘要,但1975年以前的文献无英文摘要。5%文献有免费全文,大部分文献有全文链接。

简介

PubMed是一个免费的搜寻引擎,提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要的数据库。它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的资源,像是生化学细胞生物学。该搜寻引擎是由美国国家医学图书馆提供,作为Entrez资讯检索系统的一部分。PubMed的资讯并不包括期刊论文的全文,但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的链接。

PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它是NCBIEntrez整个数据库查询系统中的一个。PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的链接,其内容包括:脱氧核糖核酸蛋白质序列,基因图数据,3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等。

PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘,可与提供原文的网址链接,提供检索词自动转换匹配,操作简便、快捷。

主要动能

词汇自动转换功能(automatictermmapping)PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表达或索引,对检索词进行转换后再检索。

MeSH转换表(MeSHTranslationTable)包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。

刊名转换表(JournalTanslationTable)包括刊名全称、美国国家医学图书馆形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[JournalNanme]”后进行检索。如:在检索提问框中键入:“新英格兰医学期刊”,PubMed将其转换为“NEng1JMed[JournalName]”后进行检索。

短语表(Phraselist)该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS:UnifiedMedicalLanguageSystem)和补充概念(物质)名称表[SupplementaryConcept(实体)Namd]。如果PubMed系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。

数据库

PubMed医学文献检索服务系统,其数据主要来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Recordinprocess、Recordsuppliedbypublisher等。数据类型:期刊论文、综述、以及与其它数据库链接。

美国国家医学图书馆收录1966年以来的包含医学、护理、兽医学、健康保健系统及前临床科学的文献1600万余条书目数据(2005年数据),记录的标记为[PubMed-indexedforMEDLINE]。这些数据来源于70多个国家和地区的4800多种生物医学期刊,近年数据涉及30多个语种,回溯至1966年的数据涉及40多个语种,90%左右为英文文献,70%~80%的文献有着者撰写的英文摘要。

InProcessCitations1996年8月开始,每天收录由美国国家医学图书馆的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为[PubMed-inprocess]。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时,每星期转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。

OLDMEDLINE:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要,记录的标记为:[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]。

Publisher-SuppliedCitations(ArticlesNotinMEDLINEorINProcess)是由出版商提供的电子文献,每条记录标有[PubMed–assuppliedbypublisher]。这些文献包括两种来源:MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到InProcessCitation中去,换上[PubMed–inprocess]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于美国国家医学图书馆收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINEUI。

服务项目

1.JournalDatabase:可透过输入期刊刊名、ISSN或Medline刊名缩写查询期刊的出版资讯。

2.MeSHDatabase:点选此功能后,在检索栏位中输入欲查询的词汇,可浏览PubMed资料库中所使用控制词汇。

3.SingleCitationMatcher:使用栏位化的检索方式,找寻特定刊名、卷期、作者、篇名的文献资料。

4.BatchCitationMatcher:以指令式的方式批次检索资料库中相关的文献,只要输入刊名、年代、卷期、起始页、作者名、关键词其中部分栏位资料即可。

5.ClinicalQueries:临床病理资料,该功能提供临床病理资料之查询,并依HaynesRB等专家所制订的最佳化检索策略之机制,使用者可先行选择检索方向,如:治疗方式(Therapy)、诊断方式(Diagnosis)、病因(Etiology)、预后状况(Prognosis)其中的一类,并可选择预期之检索结果是较具相关性(sensitivity)或精确率(specificity)较高的。

6.LinkOut:LinkOut为PubMed提供使用者连结外部网路资源之功能选项,连结内容包括国外图书馆馆藏目录、线上电子全文、书目资料库清单、消费者健康资讯、研究参考资料等资讯。如有外部资源的连结,使用者可在PubMed摘要书目中看到LinkOut此一选项。

7.免费个人化检索服务—MyNCBI:在MYNCBI服务页建立个人检索帐号/密码后,即可使用个人化检索服务,该服务提供储存/删除检索结果、MyLinkOut设定及文献传递等个人化服务

检索方法

主题检索:在PubMed主页的检索框中键入英文单词或短语(大写或小写均可),PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并把检索结果直接显示在主页下方。例如:键入“vitaminccommoncold”后回车或点击“Go”,PubMed开始检索并把检索结果显示出来。

着者检索:当所要查询的是着作者时,在检索框中键入着者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为“着者姓空格名字首字母缩写”,例如smithja,系统会自动到着者字段去检索,并显示检索结果。

刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号,例如:molecularbiologyofthecell,或molbiolcell,或1059-1524,系统把在刊名字段检索,并显示检索结果。

日期或日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围,系统会按日期段检索,并把符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08。也可以不录月份和日子,如:2000或1999/12。

检索期刊子集(辑)检索的格式为:检索词ANDjsubseta(或jsubsetd,或jsubsetn),如:neoplasmANDjsubseta。可供检索的期刊子库有3种:AbridgedIndexMedicus(有120种重要核心期刊)、Dental和Nursing。分别使用jsubseta,jsubsetd,jsubsetn进行限定。

检索带文摘的记录检索的格式为:检索词ANDhasabstract,如:livercancerANDhasabstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其美国国家医学图书馆记录中没有文摘。

PubMed是NCBIEntrez数个数据库查询系统下中的一个。

PubMed是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。

PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。

PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:脱氧核糖核酸蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。

检索汉化

汉化,让中原地区的PubMed使用者尽量多的看到、使用自己更为熟悉的、美丽的中文

高级检索页面进行了汉化。

检索关键词进行了汉化提示。

网络词典集成

检索结果页面集成了根据北京金叶天盛科技有限公司著名产品《新编全医药学大词典》制作的网络词典,对自己不熟悉的英语可以"双击"或"鼠标选定"后查看网络词典的翻译结果。

版本介绍

GoPubmed

GoPubMed是德国2006年创建2008年成熟推出对PubMed进行语义智能检索、分类导航和深度开发的体现崭新思维的网络检索工具,也是一种对检索结果进行多维统计分析的软件。通过它用户可以节省90%以上的网上搜索时间。检索者可以很快了解检索到文献的概貌和该研究领域的研究态势,如论文作者的研究轨迹、论文的年度分布、全球核心作者及核心期刊、合着者可视化关系网络图以及作者分布世界地图等等.

PubMed-cn

PubMed-cn

丁香园旗下网站,专业的医学文献数据库,其数据每天与美国的NCBI数据中心同步一次。用户在检索文献时,可以立即看到该文献影响因子;用户可以在期刊数据库查询影响因子变化趋势、投稿指南、投稿经验等相关的信息。并且PubMed-cn提供国家自然科学基金查询,分析各个地区中标率,热门学科,是申请NSFC的好帮手。

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