多克隆位点（英语：multiple cloning site，简称MCS），也称为多位点人工接头（英语：polylinker）或多重选殖位，是指人工合成的一段脱氧核糖核酸序列，作为DNA载体且含有多个限制内切酶识别位点（最多可达20个），能为外源DNA提供多种可插入的位置或插入方案。这些位点在载体上都是单一位点，即它们在一个特定的载体质粒中只出现一次。工程质粒（engineered plasmid）中常含有MCS，可让一段或多段DNA插入该区域中，此工程质粒作为载体，可接着再插入另一端DNA或（细菌、真菌）宿主中。有时随语境不同，“多接插件”是指这种基因工程的工具，而“多克隆位点”是指利用多接头插入后形成的识别位点。

常见载体

常见的基因工程载体都具有多克隆位点，有些载体，如λEMBL4、Charon40等甚至有两个。这些载体的设计使得它们能够接受多种不同的外源脱氧核糖核酸片段，从而在分子克隆、基因表达和基因功能研究等领域发挥重要作用。通过使用含有多克隆位点的载体，科学家可以更加灵活地进行基因操作，提高实验的效率和成功率。