山东省生物信息工程技术研究中心 :山东省生物信息工程技术研究中心

更新时间:2024-09-21 05:16

山东省生物信息工程技术研究中心,2001年2月由山东省科技厅批准成立,是山东省唯一专门从事生物信息学和计算生物学研究的科研机构。

正文

山东省生物信息工程技术研究中心,2001年2月由山东省科技厅批准成立,是山东省唯一专门从事生物信息学和计算生物学研究的科研机构。研究中心主任由著名数学家、中国科学院院士万哲先教授担任;学术委员会主任为著名理论生物学家、中国科学院院士张春霆教授。

研究中心总面积800平方米,现有固定研究人员6人、兼职研究人员2人、研究生10余人。中心包含两个主要研究方向:生物信息学方向:主要借助成熟的算法并结合自己编制的软件进行基因、蛋白数据库构建、脱氧核糖核酸序列分析、蛋白质结构预测、创新药物靶点筛选、分子进化和生物分子网络行为的计算机模拟等方面的工作;

计算生物化学方向:主要借助量子化学计算、分子动力学模拟及分子对接等计算化学、计算生物学技术,研究生命起源与进化过程中的基本化学问题,探讨蛋白质及各种药物小分子的结构-功能关系并进行创新药物的设计与虚拟筛选。

作为研究与开发的基础,本中心还包含两个技术支撑实验室:

应用微生物学实验室:主要任务是采集、分离、鉴定新菌株,研究各种真菌、细菌的发酵方法,评价杀菌剂的毒理、毒力,探讨微生物次生代谢产物的合成机理;

天然产物化学实验室:主要任务是研究各种小分子生物活性物质的分离提取方法,并测定其结构,进行结构修饰及物化特性分析。

本中心的核心目标是从理论和实验两方面揭示生命的起源、进化及生理、病理过程的分子机制,并在此基础上获得在医药、农业、化工、食品等领域具有核心竞争力的生物技术。

目前中心的科研工作主要集中于以下几个课题:    1  生命起源与进化过程中的基本问题

本课题的主要目的是解答生命起源与进化过程的确定性问题,即如果生命重新起源一次,他们是否具有与现在的生命相似的组成和结构?本课题的研究在氨基酸、蛋白质、核酸及它们组成的复杂网络等各个层次上展开,所用的手段主要有量子化学计算、生物信息学分析及复杂系统行为的计算机模拟。此外,本课题也涉及手性起源、生物大规模灭绝等热点问题。

2   生物活性分子的结构-功能关系

本课题的主要目的是通过阐明生物活性分子的结构-功能关系,为解释生命现象、合理设计药物奠定理论基础。本课题的研究集中于蛋白质错误折叠、聚集机理、金属离子与自由基在该过程中的作用等方面,所用的手段主要有量子化学计算、分子动力学模拟、生物信息学建模与分析及各种波谱方法。本课题也涉及抗氧化剂、光敏剂、酶抑制剂等小分子的结构-功能关系。

3计算机辅助药物设计

本课题的主要目的是在掌握生物活性分子结构-功能关系的基础上,进行合理药物设计。本课题的研究集中于神经退行性疾病的药物设计,所用的手段主要有量子化学计算、分子动力学模拟、分子对接及生物信息学建模与分析。本课题也涉及其他药物及农药的合理设计。

本中心目前是山东理工大学重点建设的科研机构之一。我们将坚持"发挥优势、突出特色、勇于创新、重视转化"的方针,努力把自己建设成开放、流动、有国际影响的学术团体,争取尽快成为生物化学、生物物理学、化学生物学方面的国家级科研机构。

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