王任小 :复旦大学药学院教授

更新时间:2024-09-20 21:35

王任小,男,1972年04月生,复旦大学药学院教授,博士生导师。1994年09月师从北京大学唐有祺教授,于1999年07月获得博士学位。“百人计划”研究员,课题组长。2012年他获得国际化学信息学会“Corwin Hansch Award”,系中国科学家首次获得这一国际奖项。

研究方向

计算化学生物学

以分子模拟、生物信息学和化学信息学为手段,研究重要生物大分子的功能和机制,研究有机小分子和生物大分子相互作用的基本理论,发展和完善计算机辅助药物设计方法。

以与重大疾病过程相关的生物大分子作为靶标,运用计算机辅助药物设计方法并结合必要的化学和生物实验手段,寻找和设计可以有效调节这些靶标分子功能的有机小分子化合物。

承担的主要科研项目

目前承担或参与国家中华人民共和国国家自然科学基金委员会、科技部、中国科学院以及上海市科委在研项目多项。

工作经历

2005年8月至今:中国科学院上海有机化学研究所,“百人计划”研究员

2001年9月至2005年7月:美国密西根大学(University of Michigan)医学院,research investigator

2000年9月至2001年8月:乔治城大学(Georgetown University)癌症中心,postdoctoral fellow

1999年9月至2000年8月:加州大学洛杉矶分校(University of 加利福尼亚州 Los Angeles)化学系, postdoctoral fellow

2020年1月至今:王任小就职于复旦大学药学院,担任教授。

教育背景

1994年9月至1999年7月:北京大学物理化学研究所,理学博士,导师:唐有祺院士

1989年9月至1994年7月:北京大学化学系,理学学士,导师:来鲁华教授

主要成果

王任小擅长发展分子靶向药物设计的新理论和新方法,代表性成果有对蛋白配体相互作用打分函数的研究、蛋白-配体配位化合物数据库、配体分子的自动设计方法等。所发展的药物设计软件在70多个国家拥有12000余名注册用户,其中许多来自国际著名的大学、研究所以及大型医药公司,形成了广泛的国际影响,累计被他人成功应用1400余次。同时在实践中应用药物设计技术,选择Bcl-2家族等蛋白-蛋白作用体系作为靶标,成功获得了若干类抗肿瘤活性先导化合物。学术生涯已发表SCI索引论文140余篇,谷歌引用超过13400次(H指数为46),并获得国家发明专利授权和软件著作权40余项。

社会职务

王任小担任中国化学会计算机化学专业委员会副主任委员、生物物理化学专业委员会副主任委员、化学生物学专业委员会委员以及上海市药学会药物化学专业委员会委员。王任小受邀担任J. Chem. Inf. Model.、ChemMedChem、Molecular Informatics等国内外多家刊物编委。

主要获奖情况

2001年,美国Cap CURE癌症基金会Young Investigator Award

2001年,中国教育部“全国优秀博士学位论文”

2009年,中国药学会施维雅青年药物化学一等奖

主要论文

2000年以来发表的论文清单

1. 成姓, T.; Zhao, Y.; Li, X.; Lin, F.; Xu, Y.; Zhang, X.; Li, Y.; Wang, R.*; Lai, L. “Computation of 正辛醇H₂O Partition Coefficients by Guiding an Additive Model with Knowledge”, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, ASAP.

2. Zhao, Y.; Cheng, T.; Wang, R.* “Automatic Perception of Organic Molecules Based on Essential Structural Information”, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 1379-1385.

3. Wang, R.*; Lin, F.; Xu, Y.; 成姓, T. “I-SOLV: A new surfacebased empirical model for computing solvation free energies”, J. 摩尔 Graph. Model. 2007, 26, 368-377.

4. Feng, D.-J.; Wang, G..-T.; Wu, J.; Wang, R.-X.; Li, Z.-T. “ bonding-driven elastic bis(zinc)卟啉 receptors for neutral and cationic electron-deficient guests with a 三明治styled complexing pattern”, Tetrahedron Lett. 2007, 48, 6181-6185.

5. Li, C.; Wang, G.; Yi, H.; Jiang, X.; Li, Z.*; Wang, R.* “Diastereomeric Recognition of Chiral Foldamer Receptors for Chiral Glucoses”, Org. Lett. 2007, 9, 1797-1800.

6. Ma, D.; Yu, S.; Li, B.; Chen, L.; Chen, R.; Yu, K.; Zhang, L.; Chen, Z.; Zhong, D.; Gong, Z.; Wang, R.; Jiang, H.; Pei, G. “Synthesis and Biological Evaluation of 1,3,3,4-Tetrasubstituted Pyrrolidine CCR5 Receptor Antagonists. Discovery of a Potent and Orally Bioavailable Anti-HIV Agent”, ChemMedChem, 2007, 2, 187-193.

7. Tang, G.; Ding, K.; Nikolovska-Coleska, Z.; Yang, C.-Y.; Qiu, S.; Shangary, S.; Wang, R.; Guo, J.; Gao, W.; Meagher, J.; “Structure-Based 设计 of Flavonoid Compounds As a New Class of Small-Molecule Inhibitors of the Anti-apoptotic Bcl-2 Proteins”, J. Med. Chem. 2007, 50, 3163-3166.

8. Tang, G.-Z.; Yang, C.-Y.; Nikolovska-Coleska, Z.; Guo, J.; 裘姓, S.; Wang, R.-X.; Gao, W.; Wang, G.-P.; Stuckey, J.; Krajewski, K.; Jiang, S.; Roller, P. P.; Wang, S.-M. “Pyrogallol-based molecules as potent inhibitors of the antiapoptotic Bcl-2 proteins”, J. Med. Chem. 2007, 50, 1723-1726.

9. Lu, Y.; Wang, R.; Yang, C.-Y.; Wang, S. “Analysis of 配体bound H₂O molecules in high-resolution 晶体 structures of protein-ligand complexes”. J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 668-675.

10. Xu, Y.; Wang, R.* “A Computational Analysis of the Binding Affinities of FKBP12 Inhibitors Using the MM-PB/SA Method”, Proteins, 2006, 64, 1058-1068.

11. Yu, S.; Pu, X.; 成姓, T.; Wang, R.; Ma, D. “Total Synthesis of Clavepictines A and B and Pictamine”, Org. Lett. 2006, 8, 3179-3182.

12. Ma, D.; Jiang, Y.; Chen, F.; Gong, L.-k.; Ding, K.; Xu, Y.; Wang, R.; Ge, A.; Ren, J.; Li, J.; Li, J.; Ye, Q. “Selective Inhibition of Matrix metalloproteinase Isozymes and in vivo Protection against 肺气肿 by Substituted -Keto Carboxylic Acids”, J. Med. Chem. 2006, 49, 456-458.

13. Wang, G.; Nikolovska-Coleska, Z.; Yang, C.-Y.; Wang, R.; Tang, G.; Guo, J.; Shangary, S.; 裘姓, S.; Gao, W.; Yang, D.; Abaan, H. O.; Tomita, Y.; Wang, S. “Structure-Based 设计 of Potent Small-Molecule Inhibitors of Anti-Apoptotic Bcl-2 Proteins”, J. Med. Chem., 2006, 49, 6139-6142.

14. Yang, C.-Y.; Wang, R.; Wang, S. “M-Score: A Knowledge-Based Potential Scoring Function Accounting for Protein Atom Mobility”, J. Med. Chem. 2006, 49, 5903-5911.

15. Wang, R.; Fang, X.; Lu, Y.; Yang, C.-Y.; Wang, S. “The PDBbind Database: Methodologies and Updates”, J. Med. Chem. 2005, 48, 4111-4119.

16. Yang, C.-Y.; Wang, R.; Wang, S. “A Systematic Analysis of the Effect of Small-Molecule Binding on Protein Flexibility of the 配体Binding Sites”, J. Med. Chem. 2005, 48, 5648-5650.

17. Song, H.; Wang, R.; Wang, S; Lin, J. “A low-molecular-weight 化合物 discovered through virtual database screening inhibits Stat3 function in breast cancer cells”, Proc. Natl. Acad. Sci. 2005, 102, 4700-4705.

18. Wang R.; Lu Y.; Fang X.; Wang S. “An Extensive Test of 14 Scoring Functions Using the PDBbind Refined Set of 800 Protein-Ligand Complexes”, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2114-2125.

19. Real P.J.; Cao, Y.; Wang R.; Nikolovska-Coleska Z.; Sanz-Ortiz J.; Wang S.; Fernandez-Luna J. L. “Breast cancer cells can evade apoptosis-mediated selective killing by a novel small molecule inhibitor of Bcl-2”, Cancer Research, 2004, 64, 7947-7953.

20. Wang, R.; Fang, X.; Lu, Y.; Wang, S. “The PDBbind Database: Collection of Binding Affinities for Protein-Ligand Complexes with Known Three-Dimensional Structures”, J. Med. Chem. 2004, 47, 2977-2980.

参考资料

王任小.复旦大学药学院 .2024-08-21

王任小.中国化学会.2024-08-23

王任小.中国科学院大学.2024-08-23

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