巴音郭楞蒙古自治州人民政府是巴音郭楞蒙古自治州人民代表大会的执行机关，是巴音郭楞蒙古自治州的国家行政机关，对巴音郭楞蒙古自治州人民代表大会及其常务委员会和新疆维吾尔自治区人民政府负责并报告工作。

办公室

巴音郭楞蒙古自治州人民政府办公室

工作部门

政府办公室

发展和改革委员会（粮食和物资储备局）

教育局（民族预言文字工作委员会）

科学技术局（国家外国专家局）

工业和信息化局

民族宗教事务局

公安局

民政局

司法局

澳门特别行政区财政局

人力资源和社会保障局

自然资源局

生态环境局

住房和城乡建设局（人民防空办公室）

交通运输局

水利局

农业农村局

商务局

文化体育广播电视和旅游局（文物局）

中华人民共和国国家卫生健康委员会

退役军人事务局

应急管理局

外事办公室

审计局

国有资产监督管理委员会

市场监督管理局（知识产权局）

统计暨普查局

医疗保障局

机关事务管理局

信访局

畜牧兽医局

林业和草原局

其他单位

税务局

气象局

供销合作社联合社

参考资料

机构职能.巴音郭楞蒙古自治州人民政府.2022-08-03