更新时间：2023-09-22 17:05
《宝可梦：超级愿望》是由日本动画公司OLM制作的动画作品，于2010年9月23日至2013年10月3日在日本东京电视台播放，共142集。该作品是《精灵宝可梦：钻石与珍珠》的续作，简称为BW。故事背景设定在游戏作品《口袋妖怪黑·白》中的合众地方。剧情围绕着小智、皮卡丘以及新伙伴艾莉丝和天桐展开，他们一起踏上了追寻梦想和与各种宝可梦相遇的旅程。 该系列在台湾于2011年1月28日首播，并在2011年7月11日在东森幼幼台播出。在香港特别行政区，该系列于2011年11月19日在翡翠台开始播放。从第53集开始，电视广播在其官方网站的myTV提供了粤语配音版本，供香港市民回顾观看，观看期限为14天。另外，从2013年3月23日（第85集）起，该系列以高清（数码信号）和4:3标清（模拟信号）播放。在香港开电视的前52集中没有提供字幕，直到2020年3月19日（第53集）开始正式提供全面的字幕内容。
精灵宝可梦，不可思议的生物。可是，还没有人了解所有的宝可梦。以成为宝可梦大师为目标，继续着旅程的小智和伙伴皮卡丘在合众地区的冒险又开始了。
新的相遇，结识艾莉丝与宝可梦酒侍天桐的同时，各种各样的邂逅，了解同伴的重要，在战斗中洋溢炽热的友情，不断成长。
• 总监：石原恒和
• 系列构成：富冈淳广
• 角色设定：山田俊也
• 美术导演：金村胜义
• 色彩设计：吉野记通
• 编辑：边见俊夫
• 摄影导演：白井久男
• 音乐：宫崎慎二
• 音响监督：三间雅文
• 音乐合作：东京电视台音乐
• 合作：JR东日本企画
• 动画制作：OLM TEAM IGUCHI
• 动画制作人：神田修吉
• 制作：佐佐木亮（东京电视台）、田中茂裕（MediaNet）、盛武源（ShoPro）
• 制作担当：加藤浩幸
• 总导演：汤山邦彦
• 导演：须藤典彦
• 制作：东京电视台、MediaNet、ShoPro
[制作人员资料来源]
第一季
注：因福岛第一核电站事故和2011年日本东北地方太平洋近海地震，火箭队对电浆团！-前篇-和火箭队对电浆团！-后篇-延期播出。
第二季
[各话目录资料来源]
第1集 前往合众地方！捷克罗姆的身影！！
剧情图片 还没有见过的神奇宝贝…还没有见过的城镇……为了见到未知的事物，小智与皮卡丘到了全新的冒险之地──合众地方！正为了在新天地的冒险雀跃不已时，眼前出现了这地方的神奇宝贝研究权威、红豆杉博士！大家立刻前往研究所，此时，天上突然出现黑云、雷鸣大作。在那中心，有像是黑色巨大神奇宝贝的影子。下一秒，影子放出的雷电直接击中小智的皮卡丘。两颊不断放电让皮卡丘很难过。众人急忙前往博士的研究所详细检查，但是结果却出人意料。
第2集 艾莉丝与牙牙！
剧情图片 虽然皮卡丘身上发生的异变令人困惑，小智他们仍决定要在合众地方旅行。首先是为了收服这个地方的宝贝而进入森林，然後就发现摇摇晃晃的草丛。急忙用图鉴判别，结果显示是「牙神奇宝贝」牙牙。小智马上丢出神奇宝贝球要收服它！但是，神奇宝贝球击中草丛後却传出人的声音。接著，冲出来的并不是牙牙，是个女孩子。她叫做艾莉丝，而目标牙牙躲在她的头发里。
第3集 水水獭！黑眼鳄！危在旦夕！！
剧情图片 小智首先以第一间道馆的所在地三曜市为目标。接著，不知为何同行的艾莉丝，在路上遇到叫做阿丹的少年。他家好像在附近开设温泉渡假旅馆，有很自傲的沙浴的样子。正当大家准备做沙浴的时候，周围却不断冒出「沙漠鳄鱼神奇宝贝」黑眼鳄！照阿丹的说法，它们平常非常温顺，会和训练家一起享受沙浴。但是，这些黑眼鳄却突然开始拼命的挖掘地面。在它们掀起的烟尘中出现的是，带著墨镜的黑眼鳄！无视於一旁惊讶的小智等人，它张开大嘴把皮卡丘与牙牙、以及偷偷跟来的水水獭带走了。
第4集 对战俱乐部！神秘的神奇宝贝现身！！
剧情图片 朝着三曜市持续旅行的小智一行人，在途中经过的城镇发现有趣的设施。那是被称为“神奇宝贝对战俱乐部”、让训练家可以自由对战的场所。干劲十足的小智猛冲进对战俱乐部！出来迎接的是俱乐部的经理东·乔治。一番对谈后，他很快就让带着合众地方很少见的皮卡丘的小智上场。然后，对战开始！但是，正准备一口气发动攻击取得先机的时候，刺耳的警报声大作！似乎是有什么人侵入仓库的样子。
剧情图片 终于到了三曜市！小智为了在合众地方的第一场道馆赛兴奋不已，这时他面前出现一名叫做天桐的青年。天桐看到艾莉丝与牙牙相处融洽的样子，判断他们的适性很好。原来他具有“神奇宝贝酒侍”的资格，可以看出训练家与神奇宝贝的适合度。因为难得遇到，于是一行人一边聊一边请他带路到三曜道馆。然后，眼前出现了期待已久的三曜道馆。
剧情图片 结束道馆赛，小智一行人来到神奇宝贝中心让疲累的神奇宝贝复原。这时艾莉丝抱着牙牙急急忙忙冲进来！她怀中的牙牙发出浅浅的粉红色光芒，沉沉昏睡。照她的说法，睡着的牙牙完全叫不起来！就在大家为这件事困惑的时候，一位带着“食梦神奇宝贝”食梦梦的女性出现了！她叫做真菰博士，而且好像知道这种昏睡的原因。小智一行人为了解决这件事而冲出中心，却看到惊人的景象！粉红色光点从天而降，君莎小姐也发出紧急警告。
第7集 藤藤蛇．迷人收服！？
剧情图片 小智、艾莉丝、天桐，决定一起旅行的 3 个人在森林里休息时，“草蛇神奇宝贝”藤藤蛇出现，擅自吃起天桐做的蛋糕！皮卡丘急忙要去阻止它，却莫名其妙地眼冒爱心！看来，似乎是重了藤藤蛇的“迷人”。摆出一副轻视模样看皮卡丘的藤藤蛇，以敏捷的动作逃走。但是，因此燃起熊熊斗志的小智，下定决心非收服它不可，于是开始紧追不舍。
第8集 火红不倒翁与达摩狒狒！钟塔的秘密！
剧情图片 朝着下一个目的地前进的路途中，小智一行人与神奇宝贝在河边吃午餐。正当大家和乐融融的用餐时，皮卡丘与牙牙的神奇宝贝食物不见了！正要找出是谁搞的鬼时，出现了 2 只“不倒翁神奇宝贝”火红不倒翁！它们使出“喷射火焰”甩开追上去的小智等人，一转眼就逃跑了。虽然想抓它们，不过治疗受伤的神奇宝贝比较重要，所以大家赶往神奇宝贝中心。可是，2 只火红不倒翁居然出现在那里，而且还再度抢走食物。
第9集 蜈蚣王发飙！救出幼牙龙！！
剧情图片 艾莉丝与牙牙、天桐与花椰猴，相对的两组人马正在练习对战！但是，面对目前还力量不足的牙牙，花椰猴也降低了绝招的威力。艾莉丝告诉牙牙慢慢变强就好了。牙牙最喜欢总是温柔照顾自己的艾莉丝，于是决定去森林里找树果送她。然后，发现某棵高耸的树上有似乎很美味的树果！牙牙不理会急忙跑来阻止的皮卡丘，爬上了尖细的树枝要摘树果。就在只差一点点的时候，树枝折断让它倒头摔了下来，还落在"巨大唇足纲神奇宝贝"蜈蚣王身上。
第10集 劲敌对战！强敌轻飘飘！！
剧情图片 以七宝道馆为目标，继续旅行的小智一行人，在路过的城镇发现神奇宝贝对战俱乐部！小智马上就跑去找对战对手。结果竟然发现修帝的资料！他立刻提出对战要求，请东·乔治先生用实况转播器联络修帝。为了意料外的再战热血沸腾的小智，与一如以往冷淡登场的修帝，展开 5 对 5 的对战。小智派的第一只是水水獭、修帝则选择了“野鸽神奇宝贝”波波鸽。小智与水水獭利用扇贝贝进行独创的攻击，可是，修帝的波波鸽也不遑多让的使出绝招。
第11集 石居蟹！去夺回自己的房子吧！！
剧情图片 持续朝著七宝市旅行的小智一行人，在路途中遇见在切割岩石打造住居的「石居神奇宝贝」石居蟹。在他们观察著这珍贵景象时，又新冒出了三只石居蟹！其中一只顶著特别大的石块，就像是当中的老大一样。这个老大看重的，就是石居蟹努力打造出来的家！下一刻，这 3 只竟然一起攻击石居蟹，夺走了它的石头住家！目睹这种卑劣举动的小智一行人，主动表示要帮石居蟹把家抢回来。石居蟹一开始还是很警戒，不过後来渐渐打开了心扉，接著作战行动终於展开！到底会有何结果呢！？
第12集 破破袋战队与秘密基地！？
剧情图片 在旅途中经过的某条路上，眼前出现了骑著三轮车的孩子们……接著，孩子们突然往这边投泥丸子！这些孩子兴高采烈地从遭到直击的小智一行人身边通过。而且，在这个军团中的「垃圾袋神奇宝贝」破破袋还把小智的宝贝帽子捡走了！小智等人急忙要追上去时，一位叫做由梨的女性叫住他们。原来，由梨是刚才那些孩子的幼稚园老师，现在遇上了很大的困扰。大家为了弄清楚来龙去脉而前往幼稚园，却被眼前的景象吓了一跳！幼稚园竟然被垃圾山围起来，建了一座秘密基地，而且孩子们还守在里面不肯出来！
第13集 泡沫栗鼠有洁癖！？
剧情图片 小智一行人朝著七宝道馆继续旅行。途中突然冒出一名少女撞向他们！原来她叫白露，是红豆杉博士拜托她来转交东西给小智的。而转交的物品则是徽章收集盒！但是，被收在包包底层的盒子沾满灰尘、脏兮兮的。不过，拿到重要收集盒的小智还是很高兴。可是他高高举起的徽章收集盒突然从手中消失了！同时，有一只「栗鼠神奇宝贝」泡沫栗鼠跑走！它口中就咬著重要的徽章收集盒！小智他们立刻慌张地追上去。兵荒马乱的追逐战，到底会怎麼样呢！？
第14集 七宝市！博物馆大冒险！！
剧情图片 终於抵达七宝市的小智一行人，目标当然是在七宝道馆获胜、得到第二个徽章！大家与干劲十足的小智一起前往七宝道馆！可是，位於博物馆的七宝道馆门户紧闭，而且看来不太对劲……正当小智准备进行确认、伸手要开门探看的时候，从一名男性发出惨叫、从长廊另一头跑来！这名惊慌失措的男性叫做木立，是博物馆的副馆长，而他似乎被卷入了大麻烦。仔细询问木立之後才知道，这座博物馆似乎有如妖怪作祟，连续发生了奇妙的现象……
第15集 七宝道馆赛！VS 道馆训练家．芦蕙！
剧情图片 解决博物馆奇妙谜团的小智一行人，见到了道馆训练家芦蕙，终於要开始期待已久的道馆赛！不过，要前往对战场地，好像得要回答芦蕙出的任务才行。虽然对意外的发展感到困惑，大家还是惊险过关！总算抵达对战场地。使用一般系神奇宝贝的芦蕙，高声宣告要派出步哨鼠与小约克。向对手展现自己的阵容来观察反应，似乎是七宝道馆的风格。小智也紧握自己选好的 2 颗神奇宝贝球，接著，对战赛开始！芦蕙最初派出的「幼犬神奇宝贝」小约克！小智则是派出暖暖猪。可是这场对战赛，竟然出现难以置信的发展！
第16集 再次挑战七宝道馆！新绝招爆发！！
剧情图片 赌上第 2 个徽章，与芦蕙进行的道馆赛。可是小智却因为「吼叫」与「黑色眼光」这组联合招式而败下阵来。一心雪耻的小智，到对战俱乐部接受东‧乔治的特训。当然，暖暖猪与水水獭也一起受训！小智首先与暖暖猪一起，为了对付芦蕙的小约克那招强力「影子球」，进行闪躲球的特训，接著是与水水獭一起下泳池，做逆流而上的特训。他与学会新绝招的2只神奇宝贝，再度前往七宝道馆！可是，对手是身经百战的道馆训练家。对战赛出现意外的发展……
第17集 蛋中孵出的小霸王！
剧情图片 之前帮助幼稚园老师由梨时得到的神奇宝贝蛋出现变化！大家对它一边不断摇晃又一边发光的样子兴味盎然。尤其是牙牙，大概是很高兴增加新同伴，特别热心地一直观察。就在闪烁速度变快，看来终於要孵化的时候，开心得手舞足蹈的牙牙竟然撞到了蛋！而蛋就以飞快的速度滚下斜坡！小智等人急忙追上去，可是不断加速的蛋被石头弹起，飞向空中了！这样直接砸到地面的话蛋会破掉的！突然发生重大危机！到底会有什麼结果呢！？
第18集 矢车森林！虫宝包与亚堤！！
剧情图片 继续踏上旅程，前往下一间道馆所在地飞云市的小智一行人，在矢车森林遇到一只「裁缝神奇宝贝」虫宝包。为了收服好强不认输的虫宝包，小智热血沸腾地直接往森林深处冲！结果，大家在像迷宫一样的森林里迷路了！3人努力想要回到进森林的路，於是爬上高耸大树找路。可是，小智没有找到路，却找到了吊在树枝上的巨大树叶堆！下一个瞬间，树叶散开，飞云道馆的道馆训练家‧亚堤竟然飒爽现身！大家一边谈话一边走入森林，就看到刚才见过的虫宝包……
剧情图片 在前往飞云道馆的路上，跃入小智一行人眼帘中的，是新开幕的友好商店！兴奋期待的往里面一看，可以看到最里面出现排队人潮。看样子，似乎是公认神奇宝贝酒侍，在那里品评训练家与神奇宝贝的样子！很感兴趣的小智一跑进去，就遇到一个女孩子。她的名字叫赤霞珠，据说确实具有公认的酒侍资格。小智让她看自己最自豪的神奇宝贝。可是下一个瞬间，眯起眼睛、对著神奇宝贝图鉴开口的赤霞珠，说出令人不敢置信的话……
第20集 皮卡丘对黑眼鳄对鸭宝宝！！
剧情图片 小智与皮卡丘目前陪著从蛋里孵出来的滑头小子进行特训。就在打算休息一下吃午餐的时候，他们掉进隧道状的洞穴里了！在抵达地点等著他们的，是以前见过的戴墨镜黑眼鳄！它似乎是为了挑战皮卡丘要求对战，才会挖洞找大家来的。面对斗志高昂的黑眼鳄，小智与皮卡丘决定答应对战。可是，这时冒出一只「水鸟神奇宝贝」鸭宝宝，抢走了黑眼鳄的墨镜！其实这只鸭宝宝超爱恶作剧，它接二连三地做出让小智他们感到困扰的恶作剧，但是……
第21集 天之箭桥与哥德小姐！
剧情图片 小智一行人抵达通往飞云市的大桥「天之箭桥」，但是桥上却起了雾、让人看不清楚。无论如何都要赶著过桥的小智他们，毫不在意的开始过桥。这时候，「天体神奇宝贝」哥德小姐从雾中现身，出手攻击他们！不得以之下，小智派出藤藤蛇应战，四周却突然被光线包围，回神过来就发现大又回到桥下了。可是，周围看起来却不太对劲……在小智等人正感到不安的时候，一个叫莎丽的少女向他们打招呼！而带著笑容跟在她身边的，正是袭击小智他们的哥德小姐！
第22集 飞云市！百足蜈蚣恐慌！！
剧情图片 总算抵达飞云市了。当地不愧是被称为合众地方中心的城市，四处都是高耸的建筑大厦。小智的目的当然是与亚堤进行道馆赛……可是，在街上与一行人偶遇的亚堤却说，现在有很挂心的事情，没心思进行道馆赛。问题就在，城里的虫系神奇宝贝们出现奇怪的反应。为了查明原因，小智他们展开共同行动，最後追到了地下水道。就在那里，出现了一只「唇足纲神奇宝贝」百足蜈蚣。而且，它就像亚堤说的一样，情绪躁动又显出强烈的敌意。而这个变异，隐藏著令人恐惧的事实！！
第23集飞云道馆赛！
剧情图片 小光漂亮的晋级到第二次审查，接下来终於要进行华丽对战赛！小光与神奇宝贝们都气势十足。这次是要以象牙猪、帕奇利兹搭档配合，不断特训的「冰灿水晶灯」一决胜负。阻挡在小光面前的对手，是在第一次审查演出至今无人见过的强烈表演的乌拉拉！在兴奋狂热的会场，对战开始！首先发动攻势的，是顺著高昂气势出手的乌拉拉。尖牙陆鲨与火精灵的组合招式爆发威力！相对於随後一口气趁胜追击的乌拉拉，小光他们一直难以抓到机会扭转情势。要让这种状况逆转，只能以大绝招放手一搏……究竟这场对战，会由谁获胜！？
第24集要小心可爱脸蛋 被导电飞鼠电到发麻
剧情图片 在与白露同行前往雷文市的途中，「飞鼠神奇宝贝」导电飞鼠出现在小智一行人面前！导电飞鼠帮牙牙捡回树果的可爱模样，把神奇宝贝们都迷倒了。那可爱的模样让白露兴奋不已，马上决定要进行对战收服它！可是，导电飞鼠在对战中使用迷人让对手无法战斗，直接逃走了。白露急急忙忙追上去，但是牙牙不知道为什麼也一起追过去了。它似乎是想要向帮了自己的导电复齿鼯鼠回礼。可是这只导电飞鼠有著令人意想不到的秘密……
剧情图片 艾莉丝才刚收服导电飞鼠，就马上开始进行对战特训。可是，一开始和白露的泡沫栗鼠对战，导电东方蝙蝠就在没有指示的状况下使出「交换伏特」，和其他神奇宝贝交换！而且，它的交换伏特有点奇特，就连小智和天桐的神奇宝贝都被拉出来交换！躲在树上高高兴兴看大家慌成一团的导电飞鼠，似乎很爱恶作剧的样子。它使用迷人使唤异性神奇宝贝，又装哭让大家向它道歉，为所欲为！但是，有只以锐利眼神观察这一切的神奇宝贝……
第26集 烛光灵大宅的恐～怖故事！
剧情图片 以雷文市为目的地，持续旅行的小智一行人，因为突然下起大雨而四处找地方躲雨。接著小智他们总算找到一栋在山丘上的洋房，决定进去休息一下。但是这时候，书架和花瓶自己动了起来，开始攻击小智一行人！大家一边逃命，一边靠皮卡丘的十万伏特勉强甩开攻击。其实这是「蜡烛神奇宝贝」烛光灵搞的鬼！发现这点的小智等人，追问烛光灵这麼做的原因。而透过萤幕监视他们的人影是……这座宅第隐藏的恐怖秘密即将真相大白！
第27集通往龙之大师之道！幼牙龙对赤面龙！！
剧情图片 在牙牙与滑头小子进行对战特训时，森林中传来神奇宝贝的吼叫声。那声音是「洞穴神奇宝贝」赤面龙发出来的！它还突然使出集气弹攻击，让小智一行人急忙闪避。这时候，有位追著赤面龙而来的训练家。名叫艾咪的少女是赤面龙的训练家，她似乎是跟丢了突然开始大闹的赤面龙。对龙系神奇宝贝特别有兴趣的艾莉丝靠近一看，发现赤面龙的脚上缠了粗重的钢索。看来它是因为这样才开始大闹的。看到艾莉丝的应对方式，艾咪拜托她教导自己龙系神奇宝贝的养育方法……
第28集 失的扇贝贝！水水獭最大的危机！！
剧情图片 朝雷文市继续旅行的小智一行人，遇上带著「带电神奇宝贝」斑斑马的训练家‧肯尼洋要求对战！自愿在这场对战中出场的，竟然是水系的水水獭！它干劲十足，打算用自傲的扇贝贝把任何攻击都打回去。水水獭在对战刚开始的时候华丽的闪躲过电系绝招，但是在被斑斑马威力强大的「连环腿」击中时，重要的扇贝贝被打飞到很远的地方去！水水獭与小智急忙跑去寻找，可是到处都找不到扇贝贝。失去最大的武器，让水水獭哑然失色。为了鼓励水水獭，小智等人开始寻找可以代替扇贝贝的东西，可是……
第29集 恋爱中的木棉球乘风飞翔！
剧情图片 小智他们像往常一样进行特训，结果有一只「棉球神奇宝贝」木棉球跑了出来。照天桐的说法，这个时期木棉球会集体行动，然後成双成对的踏上旅程。这只木棉球似乎是和团体走散了。可是他这样是有理由的。滑头小子在草丛的对面发现另一只木棉球！看来最初遇到的木棉球，是因为喜欢上这一只才追过来的。要得到芳心就得展现自己的坚强实力，这是木棉球的规矩。可是，最初遇到的那只木棉球在对战中被轻松打败了。看到它後悔不甘的样子，小智一行人决定帮忙进行对战特训……
第30集 小灰怪与不明飞行物体！
剧情图片 为了准备应付前往雷文市的漫长旅程，小智一行人沉沉睡去休养生息时，突然有发出惊人光芒的神秘飞行物体飞过，那行动看来就像幽浮一样……天亮之後，小智他们马上四处打听有关神秘飞行物体的情报，得知有位井守博士住在郊外的研究所。为了向他请教，大夥决定前往研究所，可是，到了门口的3人却遇上不可思议的现象！脑中突然浮现从来没有看过的影像！突然发生的事情让大家感到不安，而且，有个在暗处观察这状况的身影。那是手上光点会不规则闪烁的「脑神奇宝贝」小灰怪……
剧情图片 小智一行人继续旅行，在准备吃午餐的时候，意外遇到了带著「新雪神奇宝贝」迷你冰，打算进行对战收服蓝蟾蜍的修帝！但是，小智打乱状况，让蓝蟾蜍跑掉了。在修帝打算离开的时候，小智要求进行对战。原本要拒绝的修帝，因为被艾莉丝笑他想逃走，答应进行 3 对 3 对战！小智最先派出的是藤藤蛇！而修帝派出的是藤藤蛇的进化型，青藤蛇！第 3 次的劲敌对战，会由谁获胜！？
第32集 蓝蟾蜍、泥巴鱼！水边的战斗！！
剧情图片 在与修帝对战时，小智发现到水水獭的意外弱点，那就是「在水中睁不开眼睛」。为了立刻开始特训，它们来到一个大水池！小智将其他同伴交给艾莉丝照顾，陪著水水獭特训，但是却一直没有成果。同一时间，艾莉丝放任神奇宝贝四处玩耍，可是滑头小子竟然对躲在草丛中的「蘑菇神奇宝贝」宝贝球菇"使出铁头功！结果，生气的宝贝球菇对大家喷出毒粉末，让大家都中毒倒地！附近没有神奇宝贝中心，在这种危急状况下，能依靠的只有水水獭……最後到底会怎麼样呢！？
剧情图片 在前往雷文市的旅途中，突然出现一名拦路挑衅的少女‧蓝葛雷。她的目标是来自龙之乡的艾莉丝！蓝葛雷似乎是被称为「龙之破坏者」的冰系训练家，而且好像是为了与艾莉丝对战而刻意埋伏等待。受到嚣张挑衅让艾莉丝非常愤怒，决定答应进行对战！蓝葛雷派出的是「结冻神奇宝贝」冻原熊。艾莉丝则是理所当然地选了牙牙应战！可是，不只是适性不佳，遇上冻原熊压倒性的力量，牙牙一下子就失去战斗能力。懊悔不已的艾莉丝，对小智他们说出了藏在心里的想法……
第34集 石丸子！发射电炮光泽吧！
剧情图片 继续踏上旅程前往雷文市的小智一行人，在某座森林休息。这时候，冒出了一只「地幔神奇宝贝」石丸子，而且大闹一场！它的举动挑起小智的收服意愿，马上派出水水獭、暖暖猪应战，没想到却惨败！最後还不得不到神奇宝贝中心去治疗。石丸子看著一行人离去，而它会大闹似乎是有原因的……结束治疗後，大家与乔伊小姐聊天的时候，有位男性出现了。他好像是来为突然断水的神奇宝贝中心维修管线。但是，建筑物内都没有问题，原因似乎出现洞窟的水源。而且，这个水源地似乎隐藏著不得了的秘密！！
第35集酒侍侦探天桐！差不多娃娃失踪事件！
剧情图片 持续旅行的小智一行人，在浓雾弥漫的森林中迷路了。这时眼前出现人影……大夥儿为了问路靠过去，才发现那是「听力神奇宝贝」差不多娃娃！可是，它看起来不太对劲，完全无视小智他们，摇摇晃晃的走掉了。大家正急著要追上去时，君莎小姐却像要拦路一样的出现了。而且，她竟然还说要逮捕小智一行人！大家想尽办法解开君莎小姐的误会，向她打听详细的状况。根据她的说法，城镇里各处的差不多娃娃都突然失踪了！小智等人也决定协助处理这种异常状态！可是，这个事件却有著意想不到的结局！！
第36集 化石复活！古代怪鸟始祖大鸟！
剧情图片 小智一行人，在某个城镇与红豆杉博士及真博士重逢。2 位博士正打算以「羽之化石」让「最古鸟神奇宝贝」始祖小鸟复活。将化石放入巨大机械中按下开关、靠梦梦蚀的能量将出力提高後，伴随著机械中传来的吵杂叫声，一只始祖小鸟出现了！只是，才刚醒过来、处於兴奋状态的始祖小鸟向各处胡乱使出「龙吸」！成功安抚始祖小鸟的是小智一行人。感情融洽的小智与始祖小鸟展开了飞上天的特训，火箭队却在这时出现……
第37集 钓鱼酒侍‧天桐登场！
剧情图片 继续旅行的小智一行人，又遇到那个很吵闹的人物……被猛力撞上的小智，照例摔进了河中。一直鞠躬道歉的少女，原来是白露！她是为了报名参加附近城镇的钓鱼大赛而急著赶路。天桐一听说这件事就彻底变脸！他似乎是热爱钓鱼到有了钓鱼酒侍的别名。败在干劲十足的天桐的气势下，於是大家和白露一起去登记参赛。在河边特别设置的会场里，有一大群充满活力的水系神奇宝贝！可是，这场钓鱼大会隐藏了某个秘密…
第38集 索罗亚电影！神奇宝贝骑士传说！
剧情图片 小智他们在半路经过的电影院，有了惊人的邂逅！竟然有「恶狐神奇宝贝」索罗亚出现！训练家路克总是用这只爱变成电影女主角的索罗亚当主角拍电影，受到他的邀请，小智一行人也一起参加了电影拍摄！小智演出的，是为了解救索罗亚扮演的公主，勇敢对抗海盗天桐的神奇宝贝骑士！一边为不习惯的演戏苦战，一边努力拍到了剧情高潮场景，也就是完成在传说的龙之大师‧艾莉丝指导下的修行，终於要与天桐决战的时刻！可是这时候，出现意想不到的人来捣乱，让电影陷入作废的危机……
第39集 全体集合！东‧乔治对战！
剧情图片 完成电影拍摄工作的小智一行人，为了参加东‧乔治主办的「东‧乔治对战」，与路克一起来到了雷文镇。至今在旅途中遇到的训练家们也都齐聚一堂！名字很容易叫错的肯尼洋、神奇宝贝酒侍赤霞珠、龙之破坏者蓝葛雷、吵吵闹闹的白露，还有劲敌‧修帝！而且连天桐、艾莉丝与路克都决定参赛，小智的斗志飙到最高点！伴随著东‧乔治的开赛宣言，对战分组也陆续出炉。终於到了发表小智对战对手的时候，萤幕上应出来的，竟然是……
40集激战东‧乔治对战 藤藤蛇 VS 驹刀小兵
剧情图片 雷文镇的「东‧乔治对战」终於开始了。在神奇宝贝对战俱乐部的东‧乔治所主办的这场对战锦标赛中，小智与碧霞珠展开对战！大显身手的蓝蟾蜍让小智漂亮的通过第一轮。但是，从天桐 VS 修帝、白露 VS 甘尼洋开始，第一轮就接连出现火热的对战！继蓝葛雷、安东尼、小智之後，能够晋级第 2 轮的究竟是谁？接著发表的第2轮对战分组，小智的对手出人意料的是！而藤藤蛇也面临危机！？小智能够扳倒强敌、顺利的打入东‧乔治对战的准决赛吗？而最後获胜的又会是谁……
第41集火热的东乔治对战导电飞鼠 VS 打击鬼
剧情图片 雷文镇神奇宝贝对战俱乐部的东‧乔治举办了对战锦标赛「东‧乔治对战」。小智在第 2 轮与龙之破坏者‧蓝葛雷展开激战，被逼入走投无路的绝境。蓝葛雷的驹刀小兵锐利的攻击，让小智的藤藤蛇苦於应对。小智能够突破这个危机，晋级准决赛吗！？随後上场的是天桐 VS 路克、艾莉丝 VS 肯尼洋的对战。天桐的泥巴鱼与路克的燃烧虫、艾莉丝的导电东方蝙蝠与甘尼洋的打击鬼火花四射的猛烈冲突！白热化的对战之後，赢得准决赛的人物，究竟是谁！？
剧情图片 东‧乔治举办了对战锦标赛「东‧乔治对战」。小智一路过关斩将，朝著决赛前进。接下来的准决赛第 2 场比赛是艾莉丝 VS 路克。艾莉丝的牙牙在大赛中初次参加对战赛，路克的泥偶小人发出的连续攻击令它束手无策，陷入只能闪躲逃避的危机。可是，牙牙在紧要关头使出了新绝招，漂亮的逆转击败路克的泥偶小人，让艾莉丝拿下通往决赛的门票。到了决赛，小智与艾莉丝展开了炽烈的对战！小智‧艾莉丝在决赛中会选择什麼神奇宝贝！？称霸命运之战，成为东‧乔治对战优胜者的到底是谁！？
第43集交涉喵‧喵喵 头巾混混说服作战
剧情图片 小智他们为了达成得到第 4 个徽章的目标，继续旅行前往下一间道馆的所在地雷文市……可是，他们发现火箭队的喵喵遍体鳞伤地倒在路边。在小智等人的治疗下，喵喵恢复了意识。喵喵说，它是因为执行任务失败而被总部宣布开除，与武藏、小次郎分道扬，身心俱疲的四处流浪。看到喵喵这个样子，小智、艾莉丝与天桐提议要它跟大家一起旅行。喵喵也决定答应不再做坏事的约定，加入他们旅行。这时候，牙牙被头巾混混绑走了！？
第44集 小心扒手猫！喵喵与水水獭！！
剧情图片 因缘际会下开始与喵喵一起旅行的小智他们，遇上了一只扒手猫。一眼就被「刁蛮神奇宝贝」扒手猫的可爱模样迷倒，喵喵与水水獭竟然为了吸引扒手猫的注意，展开了追求大战。扒手猫则对它们表示自己的朋友被困在洞窟，拜托它们前去帮忙。以前曾经在扒手猫手下吃过苦头的天桐，表明了他不信任对方的立场。但是，小智和艾莉丝还有喵喵和水水獭相信扒手猫，决定跟著它到洞窟去！？
第45集 大宇怪与双卵细胞球与梦境小偷！！
剧情图片 小智一行人带著喵喵这个新成员，一起前往雷文市。因为天色暗了下来，一行人开始准备露营，喵喵则去寻找适合当柴火的树枝。在喵喵找不太到适当枯枝的时候，「脑神奇宝贝」大宇怪出现，送给它一整捆木柴。大宇怪表示「可以帮大家实现任何愿望」，提供了现在正缺少的食材。看到这情景，天桐说出了希望在度假饭店套房好好睡一觉的愿望。跟著大宇怪走的小智一行人，在应该什麼都没有的森林中找到一家气派的度假饭店。虽然感到不可思议，他们还是住了下来，可是……
第46集交涉喵‧喵喵！突破冻原熊的森林吧
剧情图片 在前往雷文市的途中，小智一行人来到了某座山上。当他们在因为暴风雨而一片混乱的山路上前进时，发现了倒在路边的「结冰神奇宝贝」喷嚏熊。为了让喷嚏熊回复体力，大家分头去找食物，但是就在终於找到树果时，「结冻神奇宝贝」冻原熊出现了。喵喵以交涉喵的身分介入，想要安抚激动的冻原熊，可是冻原熊却毫不留情地使出「冻风」攻击过来。在山林保安官克力弗的神奇宝贝「武术神奇宝贝」功夫鼬帮忙下，惊险逃过一劫的他们，能够顺利让喷嚏熊回到原本的族群吗！？
第47集 疾奔！对战地下铁！（前篇）
剧情图片 抵达雷文市的一行人，搭乘地下铁前往神奇宝贝中心。天桐这个地下铁酒侍兴奋不已地凝视著驾驶座，但是列车却突然紧急停车。往窗外一看，隔壁的轨道上有从未见过的车型驶过。他们在查探时，与管理雷文市地下铁的地下铁总控官北尚、南厦会合。根据两人的说法，最近出现了不在时刻表上的「幽灵列车」。虽然很在意幽灵列车的真面目，一行人还是前往神奇宝贝中心。听说提供了平常的神奇宝贝中心没有的，让神奇宝贝身心都获得疗愈的特别服务，小智一行人决定把所有神奇宝贝都寄放在这，结果却是！？
第48集疾奔！对战地下铁!!（后篇）
第49集 道馆训练家是超级模特儿小菊儿登场
剧情图片 小智等人为了得到第 4 个徽章，与白露来到雷文道馆。雷文道馆的道馆训练家，是使用电系神奇宝贝的当红模特儿小菊儿。白露马上就要求进行道馆赛，没想到到了对战场地，却发现白露的父亲已经等在那里要带她回家。白露试著说服父亲让她继续旅行，但是她父亲却完全听不进去。这时候，小菊儿提议进行道馆赛，让白露的父亲看看她有多少成长。接著白露答应了父亲的条件，只要在与小菊儿的道馆赛中输了就会回家。於是，小菊儿的「雷电神奇宝贝」雷电斑马与白露的「蜗牛神奇宝贝」小嘴蜗展开火热的对战。
第50集 雷文道馆！华丽的电击对战！！
小智在与小菊儿进行道馆赛之前苦思对策。为了对抗小菊儿强大的电系神奇宝贝，他决定跳过难以让小菊儿的神奇宝贝受到损伤的皮卡丘，另外挑选道馆赛成员。这让干劲十足的皮卡丘感到不满。接著，道馆赛开始。面对小菊儿的「雷电神奇宝贝」雷电斑马，小智派出"震动神奇宝贝"蓝蟾蜍对抗。具有地上系属性的蓝蟾蜍让雷电斑马的电系绝招失效。蓝蟾蜍就像小智预料的一样，打赢了雷电斑马。可是，面对下一个对手「翼手目神奇宝贝」导电东方蝙蝠，在第一场比赛消耗不少体力的蓝蟾蜍似乎开始显露疲态！？
第51集 小智、天桐对地下铁总控官！
剧情图片 打完道馆赛的小智一行人，决定靠参观雷文市来打发到吊桥修好为止的一天时间。地下铁酒侍天桐决定去搭地下铁，参加只要集满戳章就可以与地下铁总控官比赛的地下铁印章计画。另一方面，小智与艾莉丝则是选择四处观光，大家各自活动度过这一天。到大竞技场观看比赛，还去欣赏音乐剧专业等等，小智他们在雷文市到处参观游玩。不过，他们发现了一只走失的「牙神奇宝贝」牙牙，於是决定帮它找到主人。另外，正在参加地下铁印章计画的天桐，遇见了一名据说与重要朋友走散的少女，开始帮她一起找那个朋友。小智与艾莉丝、还有天桐能够找到他们各自要找的人吗！？
第52集 小智对冠军‧阿戴克！
剧情图片 正要离开雷文市，前往帆巴道馆的小智一行人，在表演者街道上遇见了劲敌修帝。据说他是因为小时候见过合众联盟的冠军阿戴克，才决心以阿戴克为目标，成为强大的神奇宝贝训练家。修帝是听到阿戴克最近会出现在这附近的传闻，才到这里来找人的。接著，见到阿戴克的小智与修帝立刻就要求和他进行对战。与冠军阿戴克的对战就此开始，为了对抗阿戴克的「撞头牛神奇宝贝」爆爆头水牛，小智派出最强的搭档皮卡丘挑战，可是……
剧情图片 朝著帆巴市持续旅行的小智一行人，在某著城镇遇到正在练舞的「仙人掌科」神奇宝贝街头沙铃「街头沙铃三重奏」以及它们的训练家。威尼卡·托比欧与「街头沙铃三重奏」想要报名神奇宝贝音乐剧的试镜大会，为了测试实力，他们要参加这城镇的神奇宝贝表演大会。为了得到优胜，托比欧他们不断练习舞蹈结束前的大绝招，可是却不顺利，看到这种情况，小智他们决定一起帮忙，结果却是！？
第54集 芽吹鹿！春夏秋冬全部到齐!!
剧情图片 要前往帆巴市的小智一行人，在途中经过的神奇宝贝中心，遇到专门拍摄神奇宝贝的「神奇宝贝摄影师」罗伯特。他让小智等人看了一张同为神奇宝贝摄影师的祖父拍的照片，那上面出现了有著四季不同姿态的「季节神奇宝贝」芽吹鹿齐聚的景象。罗伯特决心要找到祖父去过的地方，拍到春夏秋冬四种型态的芽吹鹿聚集在一起的照片。听到他这种决心，小智等人也决定跟罗伯特一起去找不同外貌的芽吹鹿聚集的地方……
第55集 滑头小子与任性的哥德宝宝！
剧情图片 在前往帆巴市的途中，小智他们遇到一只哥德宝宝与它的训练家小春，可是小春是个对任性的「凝视神奇宝贝」哥德宝宝言听计从的训练家。因为哥德宝宝很喜欢小智的滑滑小子，让小春拼命地要求小智把滑头小子让给她。小春一直要求用自己手边的神奇宝贝和小智交换滑头小子，可是一直遭到拒绝。之後她提出以对战决定的要求，沉不住气的小智被挑衅成功，答应小春进行对战，展开一场滑头小子争夺战。滑头小子将有什麼样的命运呢！？
第56集 艾莉丝与单首龙！抚养家修行!!
剧情图片 继续旅行前往帆巴市的小智一行人，在途中遇到神奇宝贝抚养家波比与 3 只「粗鲁神奇宝贝」单首龙。这 3 只单首龙是第一次被托付给抚养家照顾，所以想逃走去找训练家。为了帮助没有照顾过龙系神奇宝贝的波比，来自龙之乡的艾莉丝主动说要帮忙，小智他们也决定从旁协助。一群人便立刻开始照顾神奇宝贝，可是其中一只特别怕生，自从被托付给抚养家之後就不吃饭、心情低落的单首龙让大家陷入苦战。艾莉丝努力想与它交心，只是最後的结果会如何发展呢！？
第57集敏捷☆战士对几何雪男！
剧情图片 抵达帆巴市的小智一行人，立刻前往帆巴道馆要进行道馆赛。可是，道馆训练家菊老大似乎正忙著处理事情。在等待道馆开门的时间，决定到帆巴市场逛逛的一行人，遇到了机车骑士查尔斯与他的搭档「去壳神奇宝贝」敏捷虫，并且在他们带领下四处参观。在大家逛街的时候遇到了小偷，这时当地的英雄 "敏捷☆战士" 与敏捷虫现身，帮忙逮捕了犯人。小智因此成了 "敏捷☆战士" 迷。听查尔斯说敏捷☆战士晚上可能出现在港口的仓库街，小智决定去仓库街找他，可是！？
剧情图片 为了准备与帆巴道馆的菊老大进行道馆赛，小智正勤於特训。可是，天桐的兄弟，也是三曜道馆道馆训练家之一的伯特出现了。伯特说想看看天桐修行的成果，突然要求进行神奇宝贝对战。兄弟对战就此开始。伯特派出搭档「高温」神奇宝贝爆香猴，天桐则是以「草猴」神奇宝贝花椰猴迎战，并且漂亮地获胜。把败战责任推到爆香猴身上的伯特，却在被众人责备之後负气跑走。原来，伯特是因为遇上身为道馆训练家的对战瓶颈，在与寇恩吵架之後离家出走了！？
第59集龙卷云VS雷电云VS土地云！（前篇）
剧情图片 菊老大说只要有复活之草就考虑进行对战，於是小智一行人立刻出发前往三云岛。抵达岛上後，他们见到了借助搭档「花饰」神奇宝贝裙儿小姐帮忙，专门采摘复活之草的青年尤特。根据尤特的说法，最近可能是因为三云岛的土地变得贫瘠，草系神奇宝贝都失去活力，甚至连复活之草都枯萎了。尤特与小智一行人遵照三云岛的传说，为了向丰穰之神土地云祈愿，举行了祈雨仪式，可是这时风之神龙卷云却突然出现！？
第60集龙卷云VS雷电云VS土地云！（后篇）
剧情图片 为了得到复活之草，小智一行人开始进行向丰穰之神土地云祈愿的祈雨仪式。可是，出现的却不是土地云，而是让整座岛陷入严重混乱的风之神龙卷云与雷之神雷电云！具有避邪作用的石碑楔石，遭到了不名人士破坏！为了平息两只神奇宝贝的战斗，小智等人努力召唤出了土地云，可是在战斗当中，牙牙与哥德小童都受了重伤。而且火箭队竟然还想捕捉因为战斗而耗尽体力的雷电云、龙卷云和土地云这 3 只传说的神奇宝贝！？
第61集 地底的道馆赛！VS菊老大!!
剧情图片 在三云岛顺利取得复活之草的小智一 行人，终於可以和帆巴道馆的道馆训练家菊老大进行道馆赛了。从小就与神奇宝贝一同挖掘矿山的菊老大，对於以「地上」系神奇宝贝为主的力量行对战充满自信。接著道馆赛开始。菊老大的第一只是「沙漠鳄鱼」神奇宝贝混混鳄。小智则是派出「海獭」神奇宝贝水水獭进行挑战。虽然水水獭勇敢的施展喷射水柱进攻，却因为混混鳄的沙雹，眼睛进了沙子。之後，混混鳄对无法准确使出绝招的水水獭发动猛攻。正当大家以为毫无胜算的时候，小智想到的作战方式是什麼呢？
剧情图片 小智一行人继续旅行前往吹寄市，可是皮卡丘却在半路上，被「黏住」神奇宝贝电电虫吸走电力。想要帮助皮卡丘的泥巴鱼与导电飞鼠也同样被吸走电力，造成体力严重耗损。为了救助 3 只神奇宝贝，立刻赶往神奇宝贝中心的众人，从乔伊小姐口中得知那一带本来是没有电电虫的。正当大家感到不可思议时，白露急急忙忙冲进来撞到小智。原来她正赶著要与红豆杉博士联络。白露总算连络上人在电石洞穴的博士，可是实况转播器的通讯却突然中断了。看来是博士所在的洞穴里停电了……
第63集 通讯交换进化！骑士蜗牛与敏捷虫!!
剧情图片 小智他们见证了白露的「蜗牛」神奇宝贝小嘴蜗，与红豆杉博士的「啃咬」神奇宝贝盖盖虫进行通讯交换的时刻。可是白露的小嘴蜗性格胆怯，就算在交换前进行对战也是被个性积极的盖盖虫压著打，感觉并不顺利。之後，终於开始进行通讯交换！小嘴蜗进化成「去壳」神奇宝贝敏捷虫，盖盖重则是进化成「骑兵」神奇宝贝骑士蜗牛！！可是，来到白露身边的骑士蜗牛与小嘴蜗的时候完全不同，变得很有攻击性，更加难以控制。这时候，红豆杉博士提议要与小智、天桐进行双打对战……
第64集黑英雄的遗迹！象征鸟与死神棺!!
剧情图片 继续旅行前往吹寄市的小智一行人，遇上了传说中的神奇宝贝研究者‧红豆杉博士的父亲。小智他们听说博士说在附近找到了过去英雄与被称为传说的神奇宝贝‧捷克罗姆交流的遗迹，现在正要去探查，也拜托他带大家一起去。不过，遗迹似乎是个被古人设置了无数陷阱的危险场所。接下来，才正开始四处探索，就突然遭到遗迹的守护神「化兽鸟」神奇宝贝象徵鸟攻击！小智他们惊险地逃进放在大房间里的棺材，可是那里竟然冒出了「棺木」神奇宝贝死神棺…而且艾莉丝变成木乃伊了！？究竟小智他们能不能平安逃离遗迹呢！？
第65集
剧情图片 二对二对战！皮卡丘・混混鳄VS蜈蚣王・蟾蜍王!! 带著墨镜的混混鳄突然出现在小智等人面前。原来，竟然是把皮卡丘当成对手的混混鳄一路追著小智他们来了！这时候，在镇上遇见的少年尼克，拜托小智把皮卡丘借他。问了之後才知道，因为朋友格兰要求进行神奇宝贝对战，可是还不是训练家的他没有神奇宝贝。另一方面，格兰则是要求另一个朋友赛恩去借他父亲的神奇宝贝蜈蚣王与蟾蜍王。小智答应借出皮卡丘，可是…还需要一只神奇宝贝。这时，混混鳄主动说要参战。皮卡丘与混混鳄的组合，到底会有什麼结果？
剧情图片 旅途中在森林里迷路时，暖暖猪与水水獭吵了起来。这时候，小智一行人突然遭到「撞头牛」神奇宝贝爆爆头水牛攻击。虽然勉强逃过一劫，可是艾莉丝、暖暖猪、水水獭、藤藤蛇与牙牙他们，和小智等人走散了。艾莉丝他们遇到来巡逻的乔伊小姐与差不多娃娃，得知自己闯进了爆爆头水牛的栖息地。而且爆爆头水牛具有将侵入者视为敌人攻击的习性。为了避免遭到攻击，乔伊小姐提供了爆炸头假发让大家戴上……大家看到彼此戴上假发的样子後开始互相取笑，结果暖暖猪与水水獭又吵了起来。被卷入争吵的牙牙被打飞弄丢了假发，却也弹到了爆爆头水牛的头上！牙牙会怎麼样呢！？
第67集吹寄道馆的空想对战！道奇挑战者天桐!?
剧情图片 小智一行人终於抵达吹寄市了。他们前往吹寄道馆找到馆训练家风露，可是道馆却是采取预约制。听说这里的对战是采用空想对战的方式，小智马上就预约了下午的名额。接著就先观察早上的道馆赛状况。没想到，空想对战是展示出彼此要派出的神奇宝贝，在风露的脑袋中进行模拟对战，不实际对战就由她判定结果！看到风露一口气处理完 15 位挑战者的对战要求，深感愤怒的天桐认为「同样身为道馆训练家的我绝对不认同！」於是要求和风露进行道馆赛。风露回应天桐「道馆赛不比不知道结果」的说法，开始进行实际对战，然而！？
第68集 吹寄道馆VS风露！空中决战!!
剧情图片 天桐努力说服却毫无成效，风露还是对空想对战充满自信。同样对空想对战怀有疑问的小智要求挑战道馆赛。面对小智的波波鸽，风露派出了波波鸽的进化型轰隆雉鸡迎击！这场比速度的空中战，双方展开一进一退的攻防拉锯。虽然唤回显露疲态的波波鸽，换上皮卡丘应战，可是电系绝招却悉数遭到封锁！面对风露的王牌神奇宝贝「首席天鹅」，波波鸽已经喘不过气…此时，波波鸽出现异状！飞行系神奇宝贝之间的对战将有何结果！？究竟最後，小智能得到第六个徽章吗！？
第69集突破难关！登上天空之塔!!
剧情图片 要前往雪花市的小智一行人，偶然地与肯尼洋重逢，并且知道了「许愿钟祭典」的事情，决定全体一起参加。这个祭典是要与一只神奇宝贝组队，通过各种竞技考验。优胜者可以得到权利，敲响据说能「实现任何愿望」的「许愿钟」。小智与皮卡丘也斗志满满的要得到优胜。他们立刻开始寻找借物竞赛需要的「雷之石」，可是皮卡丘碰到的话就会进化！？在模仿大会上，艾莉丝变成红豆杉博士！？天桐虽然完美的变身为小菊儿却被倒喝采！？突破无数难关、怪问题的小智等人背後，突然冒出带著 "脑" 神奇宝贝小灰怪的超能力者‧礼二…
第70集东乔治格斗大会开幕滑滑小子对花椰猿
剧情图片 小智一行人参加了在某格镇举行的对战大会「东乔治格斗大会。肯尼洋、白露、修帝及蓝葛雷这些熟悉的劲敌接连表明参战，开始迸出激烈的火花。「东乔治格斗大会」的主办者是神奇宝贝对战俱乐部的主人东‧乔治。因为是以肉搏战出名的格斗大会，小智决定选择格斗系的滑头小子当搭档。第一轮当中，小智他们与亚奇的花椰猿展开激战！但是滑头小子因为飞膝撞失败而动弹不得，陷入危机！花椰猿不断使出低空踢，滑滑小子接连遭受痛击，倒在对战场地上了。恐怕就到此为止了……当每个人都这麼想的时候，滑头小子受到小智鼓励，靠毅力站起来了！接著，这时候竟然发生异变！？
第71集
剧情图片 不断继续吧，东乔治格斗大会！赤面龙 vs 劈斩司令！！神奇宝贝对战俱乐部的东‧乔治，举办了对战锦标赛「东乔治格斗大会」。火热的第一轮比赛，艾莉丝选择了龙头地鼠当搭档，迎战神奇宝贝女酒侍‧赤霞珠的双刃丸。面对水系的双刃丸，具有地上系属性的龙头地鼠显得不利…而且，赤霞珠与双刃丸的组合搭档，成长幅度高出神奇宝贝酒侍‧天桐的预想！艾莉丝该怎麼办！？接著轮到蓝葛雷与葛瑞丝的对战。龙之破坏者蓝葛雷，斗志高昂地要与龙系的赤面龙对战！具有诡异气质的正臣与搭档投射鬼一起出场，与杜蒙的功夫鼬激烈冲突，可是……
第72集决战东乔治格斗大会！投射鬼对打击鬼
激战东乔治格斗大会！劈斩司令对炎武王！！激战不断的肉搏战对战锦标大赛「东乔治格斗大会」，第一轮最後一场对战，是白露的炎武王与修帝的修缮老头激战。这是一场最终进化型神奇宝贝的对决！面对进化後威力提升的修缮老头，炎武王陷入苦战遭遇危机！！就在这时候，白露做出了惊人的指示！？而且，肯尼洋与天桐展开了充满魄力的对战！肯尼洋的打击鬼接连躲过天桐的花椰猴攻击，以浑身之力使出手刀！但是，花椰猴也不甘示弱地使出咬咬攻击企图扭转情势！东‧乔治认为最有冠军相的正臣与投射鬼，则是游刃有馀的一路过关斩将顺利晋级！？
第73集
剧情图片 决战东乔治格斗大会！投射鬼对打击鬼 肉搏对战锦标赛「东乔治格斗大会」的战况越来越热烈。准决赛的对战组合是白露的炎武王 VS 肯尼洋的打击鬼。面对以力量见长的炎武王，打击鬼展现速度！利用健美增加攻击力的打击鬼，使出得意的手刀袭向炎武王…接下来，小智与正臣之战揭开序幕。小智的滑头小子在气势上，完全被正臣的投射鬼压制住了。滑头小子使出还无法完美控制的「集气弹」来一决胜负，更展开最擅长的接近战，使出飞膝撞挑战投射鬼，结果却是！？小智的比赛将有何结果！？最後打进决赛，得到优胜了又会是谁！？
第74集 拯救牙牙！铁蚁的巢穴
剧情图片 在前往雪花市的途中，小智的宝包茧在和艾莉丝的导电翼手目进行对战练习时，竟然进化成为「育儿神奇宝贝」保母虫了！保母虫具有用叶子制作衣服代替打招呼的习性。它马上就先为皮卡丘他们制作叶子衣服，还帮高兴得不得了的牙牙做了叶子面具。之後，在小智一行人午睡的时候，牙牙居然被铁蚁给扛走了。它们似乎是把穿著叶子服的牙牙误认为食粮了！为了找寻牙牙，小智他们仰赖保母虫的丝走进迷宫般的铁蚁巢穴。可是，里头有无数的铁蚁……牙牙会怎麼样呢！
第75集罗斯山的激战！肋骨海龟的奇迹前篇
剧情图片 为了前往雪花市，小智一行人决定穿越罗斯山的洞窟，但是却在途中迷路了。循著远方敲打声前进的他们，遇见正捧著大块岩石，非常兴奋的藤夫。原来身为业馀考古学者的藤夫，长年累月不断研究，终於挖到「古代龟神奇宝贝」原盖海龟的化石。据说原盖海龟在很久以前就已经灭绝，可是藤夫却说他在孩提时代曾与活生生的原盖海龟玩耍…当大家在罗斯山探险时，突然穿越时空到了原盖海龟的世界，让他有了不可思议的体验。小智等人对这番故事充满兴趣。就在这时候，化石被火箭队给夺走了！？
第76集 罗斯山的激战！肋骨海龟的奇迹後篇
剧情图片 罗斯山当中有被称为「时间之门」的时空扭曲存在。火箭队正计画藉由「时间之门」穿越道过去的世界。他们打算大量捕捉过去已灭绝的神奇宝贝，藉此增强战力征服合众地方！！为了让「时间之门」安定，需要「古代龟神奇宝贝」原盖海龟的生物能量…原盖海龟终於还是因为火箭队的化石复原装置，在现代世界复活了。困惑不已的原盖海龟，立刻逃走了。小智一行人找到它，带著它逃进森林，却再度遭到火箭队袭击！此时原盖海龟突然开始发光！？到底是怎麼了！？
第77集炎之回忆！暖暖猪对炎武王!!
剧情图片 小智一行人在彩穗蓬花镇的对战俱乐部休息，他们在那里遇到一名叫蘇瓦玛的少年，没想到他就是暖暖猪的前任训练家！而且，暖暖猪被舍弃的理由竟然是「没有对战的才能」。面对谴责这种做法的小智，蘇瓦玛宣称会用对战证明暖暖猪有多没用。另一方面，暖暖猪忘不掉过去的回忆，看来很没有对战的意愿。知道暖暖猪精彩表现与勤奋努力的藤藤蛇，主动要求参与对战。对手是炎系的「食蚁兽神奇宝贝」食蚁炉，以及暖暖猪的最终进化型态「大火猪神奇宝贝」炎武王。藤藤蛇即使处於不利状态仍然毫不畏惧、气势十足地展开对战！此时的暖暖猪却是…
第78集 哈奇库登场！火神虫的圣山！！
剧情图片 小智一行人来到雪花市附近的山上，当大家差点被落石砸中的时候，被正在山麓修行的哈奇库与「结冻神奇宝贝」冻原熊救了一命。原来他们是演出知名电影「冰之三部曲」的电影明星。而且有机会见识哈奇库的修行，让电影酒侍天桐极度兴奋！可是，山区突然乌云密布…感到担心的哈奇库与小智等人前往山里查探，就看到神奇宝贝猎人林藏带著 2 只"漂浮神奇宝贝"胖嘟嘟，打算捕捉「太阳神奇宝贝」火神虫！小智派出混混鳄对战，结果连混混鳄都被捉住了！事情到底会怎麼发展！？
第79集雪花道馆赛！冰之对战场地！
剧情图片 为了赢得第七个徽章，敲开雪花道馆大门的小智，眼前是一片广大的冰之对战场地！道馆训练家哈奇库最擅长运用冰系的神奇宝贝。对上"冰雪神奇宝贝"多多冰，小智派出不擅对付冰系的混混鳄！结果，多多冰发动不留反击馀地的连续攻击……小智只好让受到相当损伤的混混鳄回到神奇宝贝球。倒是对冰系占有优势，属於格斗系的滑头小子，第一次参加道馆赛就表现出色！最後赢战的敌人是雪白冰王‧冻原熊！小智相信混混鳄「绝对不会输」的意志放手一搏！对冻原熊抱有竞争心的混混鳄，究竟能不能打赢…！？ .
第80集 神奇宝贝酒侍对决! 品评对战!!
剧情图片 小智一行人正准备要出发前往双龙道馆，取得最後一个徽章。这时候，突然出现一个宣称正在找天桐的男人，把3个人都强押上车带走。小智他们随後被带到邻近镇的富豪，服部的宅第。原来是服部先生希望请优秀的A级神奇宝贝酒侍帮忙，替他的宝贝女儿小桃选出第一只搭档的神奇宝贝。他请来的另一位酒侍黑皮诺断言，"根神奇宝贝"百合根娃娃是最适合的神奇宝贝，但是小桃却一脸失望…。正当天桐将马小桃身上的香味当作提示思考时，号称是S级酒侍的醋霞珠冒了出来！可是总觉得好像在哪里看过他…！？ .
第81集种子铁球研究所！艾莉丝与双倍多多冰
剧情图片 打算去搭船的小智一行人，偶然遇见了龙之破坏者蓝葛雷与"暴风雪神奇宝贝"双倍多多冰。蓝葛雷为了得到「提高神奇宝贝能力的苔癣」，正要去种子铁球研究所。被勾起好奇心的小智等人也决定跟她一起去。苔癣是"刺果神奇宝贝"种子铁球将岩石程分吸入体内後生成的。可是在以碳化钙进行测试的房间，突然生出了大样的苔癣，甚至覆盖了研究所！小智等人仓皇避难，但是艾莉丝带著牙牙、水水獭，和她最怕的冰系神奇宝贝双倍多多冰一起被关在研究所屋顶上！双倍多多冰和慢慢接近的苔癣都令艾莉丝感到害怕…！结果到底会怎麼样呢！
第82集 电影对决！合众防卫队，出击!!
剧情图片 小智他们终於抵达设有道馆的海港城镇。根据天桐的说法，这里从以前就是电影的摄影场地，最近还有电影主题乐园落成。他们在那里碰巧与路克及"恶狐神奇宝贝"索罗亚重逢。想当电影导演的路克，受邀参加开幕前举办的活动，来到这里要参加电影大赛。参加者要在影城中使用同样的设备、同样的设定拍摄电影，比赛谁的作品优秀。在路克提议下，小智一行人也决定协助他拍电影。主角适合众防卫队的小智、皮卡丘及炒炒猪！艾莉丝饰演女主角，还因为落泪镜头陷入苦战…！？
第83-84集 激战立涌道馆!VS霍米加
剧情图片 为了得到关合众联盟出场权的第8个徽章，小智终於踏进立涌道馆的大门。那里的道馆训练家是超级庞克乐团「瓦斯弹乐团」的霍米加！这间道馆，既是现场演唱会场也是对战场地！在热爱对战＆演唱会的观众们包围下，感觉就像球队到客场比赛，不过小智还是靠皮卡丘的十万伏特炒热现场气氛。接著，自信满满的霍米加，竟然提议要采取小智派6只神奇宝贝、自己则派3只来对战的比赛方式…！霍米加派出她在关都收服的"毒气神奇宝贝"瓦斯弹！小智派出轰隆雉鸡对抗瓦斯弹的速度，可是却被「泥巴爆弹」打中，陷入剧毒状态！接下来又是毫不留情地攻击…！究竟最後是谁会获胜呢！？ .
第85集 歌唱吧，美洛耶塔！爱的旋律！！
剧情图片 知道合众联盟要在3个月後才举行比赛的小智一行人，在天桐的提议下，决定去吃立涌市的名产‧冻原熊冰淇淋。没想到，竟然在摊位前遇见神奥地方的冠军‧竹兰！原来她预定要在笼目镇举行的「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」进行示范表演赛。除了可以亲眼见识竹兰的对战，只要在大会赢得优胜，还能和合众地方的冠军阿戴克对战，这让小智等人都决定参赛。一行人就这样随著竹兰前往小波镇。途中，非常罕见的"旋律神奇宝贝"美洛耶塔出现在大家面前。但是，浑身是伤的它突然倒下…！？ .
第86集 波加曼VS花椰猴！华丽的对战！！
剧情图片 小智一行人抵达了东合众的小波镇。在搭车前往竹兰说有人等待的别墅时，"旋律神奇宝贝"美洛耶塔突然出现在车里！看来它很喜欢小智，所以跟了过来。接著，在别墅等待大家的，原来是小光与"企鹅神奇宝贝"波加曼！其实小光是为了磨练神奇宝贝协调训练家的实力，特地来到合众地方的。小智等人就此开始为了准备青少年杯进行集训！这时天桐表示「想要品评神奇宝贝协调训练家的神奇宝贝」，向小光提出对战要求！而火箭队正监视著他们的一举一动…！？
第87集 大岩蛇岛野外求生
剧情图片 小智等人在竹兰位於小波镇的别墅，为了准备参加青少年杯而不断特训。想要休息一下的小光提议，到传说有奇特的"岩蛇神奇宝贝"大岩蛇存在的无人岛去玩。在大家沿著海岸边的洞窟探险时，突然遭到大岩蛇攻击。虽然勉强逃过一劫，小智他们却与艾莉丝还有小光走散了。在返回海岸的路上，巨大的大岩蛇再度来袭！！面对兼具地上、岩石属性的大岩蛇，水系的水水獭与波加曼合力击退敌人！但是，又有更多大岩蛇冒了出来！！此时，美洛耶塔开始唱歌，它的模样却…… . .
第88集 酒侍侦探天桐！消失的喷嚏熊之谜！
剧情图片 正在小波镇进行集训的小智一行人，认识了在寻找"结冰神奇宝贝"喷嚏熊的少年克里斯。原来是他的喷嚏熊从应该是密室的神奇宝贝之家不见了。觉得担心的小智等人也一起帮他寻找。天桐发挥酒侍侦探的力量，在森林中发现可疑足迹，并且推断应该是这些足迹的主人把喷嚏熊带走。因为牙牙发现食物残渣，让天桐更确定犯人身分，继续深入森林。结果，眼前出现了边流鼻水边吃水果的"结冻神奇宝贝"冻原熊！不会吧！？这只冻原熊是克里斯的…！？事件的真相究竟如何！？ . .
第89集 艾莉丝与小霸王快龙!!
剧情图片 在竹兰的别墅，小智一行人才刚起床整理仪容。这时候，小波镇突然全镇都停电了。不久之後，君莎来别墅拜访竹兰。根据君莎的说法，是这个镇上有名的小霸王"龙神奇宝贝"快龙造成停电的。但是，听到这件事的艾莉丝坚称「龙神奇宝贝绝对没有坏孩子！」直接跑去变电所。追著艾莉丝，小智等人也跟著进入变电所，结果他们发现翅膀受伤的快龙躲在最里面的房间。可是，对人类怀有戒心的快龙开始大闹！天花板就在这时垮下来了！艾莉丝、水水獭、波加曼都被关在那个房间里…！？ .
第90集 青少年杯开幕！快龙对冻原熊!!
剧情图片「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」终於开幕。优胜者可以和合众地方的冠军‧阿戴克进行对战。大会重头戏之一的公开示范赛，是由神奥地方的冠军‧竹兰派出的"超音速神奇宝贝"烈咬陆鲨，与合众地方四天王‧嘉德丽雅的"天体神奇宝贝"哥德小姐进行对战。气氛热烈的会场，到了第一轮比赛更是全场沸腾。艾莉丝的"龙神奇宝贝"快龙vs龙之破坏者‧蓝葛雷的"结冻神奇宝贝"冻原熊，体型庞大的两者展开魄力满点的对战！快龙面对适性很差、冰系冻原熊的攻击，不知为何都正面迎击接下来！大感头痛的艾莉丝发出的指示，它也完全无视，到底会怎麼样…！？ .
第91集 力量对战！艾莉丝对小光！
剧情图片「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」不断演出热烈战斗！艾莉丝的快龙将在第二轮，与神奇宝贝协调训练家‧小光的"双牙神奇宝贝"象牙猪对战！艾莉丝在第一轮比赛，因为与快龙的默契问题陷入苦战。虽然快龙这次在开场的时候听从指示，但是这回的对战也没办法照艾莉丝的意思进行…！？另一方面，小光与象牙猪展现了超群的默契配合，接连使出绝招击中对手！这场对战，究竟会如何演变！？此外，天桐与修帝，将要进行在东格斗大会之後的第二次对战！"皇家神奇宝贝"君主蛇VS石居蟹！赌上道馆训练家威严的品评会有何结果…！？ .
第92集 小智、艾莉丝、修帝！最後的对战！
剧情图片 终於到了「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」的准决赛！小智派出混混鳄与艾莉丝的快龙进行对战。到了这时候，终於与快龙培养出默契的艾莉丝，开始能抓到对战节奏并且产生自信，很顺利地发动攻势。另一方面，与龙神奇宝贝的适性处於不利地位的混混鳄，遭到快龙的大量绝招攻击，面临重大危机！！可是，这时混混鳄的样子却…！？接著，就在小智与艾莉丝的对战越加白热化时，修帝却显露出游刃有馀的表情，断定不管由谁胜出都只是比赛的过客。将胜过合众地方的冠军‧阿戴克视为唯一目标的修帝…。到底最後，优胜会落在谁手中！？！？ .
第93集 道别与相遇的青少年杯！
剧情图片 在「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」获得的修帝，将派君主蛇与阿戴克的爆爆头水牛对战！为了向阿戴克证明自己有多强，修帝彻底研究了爆爆头水牛的特性与弱点，以准备万全的状态进行挑战。相对於此，阿戴克以冠军身分堂堂接受了这项挑战。但是等在最後的却是意外的结果…！？接著在大会结束後，小光与波加曼告诉大家，他们要到城都地方去参加米可利杯。小智对还没有比试过的小光提出对战的要求！皮卡丘VS"火山神奇宝贝"火岩鼠。彼此了解透彻的对手，展开一场堪称表现旅行成果的对战…！？ .
剧情图片 在青少年杯会场遇见的少年‧虎彻，要去赢得第8个道馆徽章，小智一行人也决定陪他一起去。一行人决定前往青海波道馆，可是小智与虎彻却在半路上跟天桐、爱丽丝走散了！脱线冒失的训练家，让"波纹神奇宝贝"利欧路与皮卡丘只能苦笑。而且还有更多试炼等著他们…！？之後，大家在虎彻的特技帮忙下，总算抵达了道馆！那里好像是水系的道馆，对战场地被设置在海湾当中。道馆训练家西子伊派出"漂浮神奇宝贝"胖嘟嘟，而虎彻则派出"刺球神奇宝贝"坚果哑铃进行对战！虽然以十万伏特给予胖嘟嘟严重打击，但是在那之後，出现预料之外的状况…！？ .
剧情图片 小智一行人为了准备参加合众联盟，正在竹兰的别墅中进行训练。就在让滑头小子练习集气弹的时候，森林的另一头传来的惨叫！大家在那里看到正在吵架的「雏鹰神奇宝贝」毛头小鹰以及「尿布神奇宝贝」秃鹰小子…！原来是练习集气弹打碎的石头弹到毛头小鹰头上，让它误以为是秃鹰小子拿石头丢它！接著神奇宝贝幼儿园的新手保母蕾拉老师出现，叹息的说这两只总是这样吵架。它们就算回到幼儿园也还是一样吵个不停…。於是天桐决定，身为神奇宝贝酒侍的他要找出原因。就在这时候，被蕾拉老师告诫行事过当的秃鹰小子跑出了幼儿园…！？ .
第96集 美洛耶塔与海底的神殿！
剧情图片 小智一行人在竹兰的别墅进行特训。以态度表示「我也想要对战」的美洛耶塔，像水水獭下了挑战书！这时候，单方面认定小智他们是坏蛋的青年拉里与「泥偶神奇宝贝」泥偶巨人突然发动攻击！美洛耶塔立刻挺身保护小智，让大家能够解开误会。原来拉里与泥偶巨人是为了保护美洛耶塔，所以走遍各地寻找它。原本住在森林深处某个秘密地点的美洛耶塔，是因为躲避不明人士攻击，才会偶然遇见小智他们的。可是这时候，小智等人发现了可疑的监视机器！发现这个地方也有危险，众人为了保护美洛耶塔而急忙离开别墅，可是眼前竟然出现火箭队的老大‧坂木…！ .
第97集 灵兽型态合力进击！合众最大的危机!!
剧情图片 合众地方压制计画「暴风雨计画」。在火箭队设计下，美洛耶塔与小智及皮卡丘被捉到海底的神殿。原来，坂木企图要利用龙卷云、雷电云与土地云等传说中的3只神奇宝贝来称霸合众地方…。由「写形镜」之力召唤而来的3只神奇宝贝，改变型态为灵兽型态，并在坂木的指示下开始暴走！总算成功逃脱的小智与皮卡丘，立刻前去救援发出悲鸣、痛苦不已的美洛耶塔！！为了解救同伴，皮卡丘发出的电球出现惊人的效果…！？坂木以及在他手下集结的火箭队，与小智等人在合众最大的战斗开始了！！ .
第98集 世界第一华丽的神奇宝贝!?
剧情图片 合众联盟的举办地确定为桧垣市，小智一行人於是离开竹兰的别墅准备前去参赛。在森林当中，他们和花园歌剧团的麻雅与"丝巾神奇宝贝"奇诺栗鼠，水树与"花饰神奇宝贝"裙儿小姐以及紫音与"捧花神奇宝贝"罗丝雷朵有了最糟的相遇。被卷入炒炒猪与水水獭争执的导电飞鼠撞上麻雅，结果麻雅竟说导电飞鼠和藤藤蛇都是「丑八怪」，让艾莉丝勃然大怒！！为了要让高傲离去的3人得到教训，小智与天桐也都盛装打扮，前往歌剧团员禁止男宾进入的宿舍。「绽艳方成华，败者凋零化尘泥」！不得了的对战即将开幕…！？ .
第99集 天空与大地的双打对战！
剧情图片 小智一行人继续踏上旅途前往要举办合众联盟的桧垣市。突然间，"勇猛神奇宝贝"勇士鹰、"鼹鼠神奇宝贝"螺钉地鼠以及它们的训练家空朗＆陆克兄弟出现，向小智与天桐挑战要求进行双打对战！！对手的两只接连使出没有任何人见过的「飞钻翼」、「神鹰遁地」、「转钢爪」，以及其他默契配合极佳的合体绝招！相对的轰隆雉鸡与花椰猴也不惶多让的驶出合体绝招应战！究竟最後结果如何…？接著，希望变得更强的二人，接受了天桐这个神奇宝贝酒侍的品评！称霸天空与大地的他们，如果可以在收服水系神奇宝贝，就是海陆空齐备的世界最强组合，到底会怎麼样？ .
第100集 艾莉丝、回到龙之乡！
剧情图片 小智一行人前往即将举办合众联盟的桧垣市，途中，他们顺便前往了艾莉丝的故乡──龙之乡。除了向大婆婆报告旅行的状况，艾莉丝也与儿时玩伴菖蒲重逢。这时蒲所培育的两只"乱暴神奇宝贝"双头龙出现了。同一天从蛋里孵化，情同兄弟的它们，哥哥今天不知道为什麼无精打采的，当小智等人在菖蒲家用餐的时候，弟弟双头龙突然慌慌张张地跑来。大家跟过去一看，发现哥哥双头龙进化成"凶暴神奇宝贝"三头龙！但是，三头龙对自己的进化大吃一惊，突然开始大闹！艾莉丝说她会设法处理，但是…… .
第101集 双龙道馆！艾莉丝VS哈卡足球俱乐部！！
剧情图片 小智一行人抵达双龙市。双龙道馆‧道馆训练家夏卡对战的艾莉丝充满斗志。可是，一想到让她难以招架的夏卡就觉得坐立难安…。艾莉丝为了让自己冷静下来而爬上双龙市的铁塔，引起骚动。不过，与在双龙学园生活时的舍监玛莎女士及学园的神奇宝贝"颚斧神奇宝贝"斧牙龙重逢，让她又重新振作起来。第一次与夏卡对战的後，艾莉丝的独断独行让龙头地鼠封闭了心灵…。这次一定要以两人的搭档合作获胜！艾莉丝使出全力对抗夏卡！"地底神奇宝贝"龙头地鼠将与"颚斧神奇宝贝"双斧战龙进行复仇对战…！！到底会有何结果！？ .
第102集 伊布队出动！神奇宝贝救援队！！
剧情图片 来到桧垣市附近山顶的小智一行人，打算强行穿越被岩石阻碍的道路，结果差点从山崖上掉下去。这时候，带著"进化神奇宝贝"伊布的青年巴吉尔与"太阳神奇宝贝"太阳精灵救了大家。巴吉尔与他的父亲和哥哥一起组成神奇宝贝救援队，守护城市。他带领的队伍名叫「伊布队」，是由伊布与伊布的七种进化型态共同进行活动。同一时间，水坝发生事件。水坝管理室的大门被"结霜神奇宝贝"几何雪花栋住，使得戴比困在里面！面对越发紧急的事态，巴吉尔与小智等人前去支援。伊布队能发挥实力吗…！？ .
第103集开幕合众联盟·桧垣大会！小智VS修帝
剧情图片 小智一行人终於抵达举办合众联盟的桧垣市，并且和白露、肯尼洋、修帝及巴吉尔等人重逢。大家顺利完成参赛登记後，正准备走回各自的宿舍时，在树林里看见了眼熟的帐棚，原来这次为了绝对不要迟到，虎彻与利欧路从三天前就在这里扎营了，可是一详谈才发现，虎彻竟然还没有登记参加大会。大吃一惊的小智，在通知结束参赛登记的广播声中，急忙拉著虎彻赶往登记柜台！他们到底赶不赶上？接著，预赛终於要开幕了！宿命的对决再次登场，小智的对手是修帝与君主蛇！而小智选的神奇宝贝是…… .
第104集 激战！在劲敌对战中取胜！！
剧情图片 接连出现强烈激战的合众联盟预赛中，轮到小智智的皮卡丘VS修帝的君主蛇这场对战！君主蛇以最擅长的必杀技龙尾与困绑连续攻击，让皮卡丘陷入重大危机。即使拼命以十万伏特应战，君主蛇也有秘策应对，这次一定要赢过修帝！小智与皮卡丘可以抢下胜利吗？接下来，劲敌们也在预赛中纷纷演出白热化的对战！复赛第一轮确定有虎彻与白露的对战！大剑鬼VS骑士蜗牛的对战，骑士蜗牛以铁壁提升防御力，使得大剑鬼的攻击一直受阻。困惑不已的虎彻拉弹头带思索对策，究竟结果会怎样…… .
第105集 牙牙！迷路走失了！
剧情图片 合众联盟‧桧垣大会很快地进入赛事中盤，小智等人都先回到宿舍。这时候，皮卡丘发现到…牙牙不见了！！一查才发现，牙牙是去追空中的气球，不小心与小智他们走散了！艾莉丝开始拚命的搜寻牙牙。另一方面，皮卡丘它们以小巷为中心四处寻找牙牙。在过程中，水水獭在巷子里发现满满一箱水果，还把它们全都吃光了。可是那是住在巷子里的"垃圾场神奇宝贝"灰尘山，从附近的住户那里得到的食物。水果就这样没了，让"垃圾袋神奇宝贝"破破袋很难过。於是，愤怒的灰尘山找上因为发现牙牙而松了一口气的皮卡丘它们…！到底会怎麼样呢！？ .
第106集 打击鬼登场！小智对肯尼洋！
剧情图片 白热对战不断的合众联盟‧桧垣大会！顺利晋级第二轮的小智，终於打进第三轮。对手竟然是肯尼洋！东．乔治对战、许愿钟对战、东乔治格斗大会，在各大会中一起战斗的肯尼洋与小智，因为熟知彼此的本领，都是预想了对方选择的神奇宝贝及绝招来准备对战！虽然因为肯尼洋的雷电斑马学会新绝招，出现意外的发展，不过小智的蓝蟾蜍也不服输的应战！然後，面对肯尼洋最强的搭档「空手道神奇宝贝」打击鬼，上场的是一度进行对战，体力大幅消耗的流氓鳄！恶系对上格斗系很不利。小智要怎麼推翻这种状况呢？ .
第107集 小智对虎彻！秘密武器三头龙！
剧情图片 晋级第4轮的小智，将要与虎彻进行对战！第4轮的6对6的全面对战！虎彻预告的秘密武器竟然是「凶暴神奇宝贝」三首恶龙！相对於此，小智派出「矿石神奇宝贝」地幔岩一决胜负！地幔岩以绝招准确的命中威力十足的三头龙！究竟结果会如何？接著，轮到虎彻最後的堡垒兼好搭档「波纹神奇宝贝」利欧路上场，面对它的高傲雉鸡打算以速度决胜负，可是利欧路竟然跳到轰隆雉鸡身上使出绝招！无法闪避的轰隆雉鸡遭受严重伤害，陷入大危机！虎彻的指示乍看之下是一团乱，可是他与利欧路的默契配合却高人一等！这时，利欧路出现异状……
第108集决战合众联盟！皮卡丘对路卡利欧!!
剧情图片 激战不断的合众联盟进入第四轮！小智与虎彻的对战成为空前混战！更意外的是虎彻的搭档利欧路进化成为「波导神奇宝贝」路卡利欧了！路卡利欧的绝招威力大幅提升！甚至还学会新绝招，逼得小智与藤藤蛇节节败退，而且已经连战两场的皮卡丘还要与路卡利欧对战！体力严重消耗的皮卡丘，为了避免长期战，决定以速度和路卡利欧拼胜负！虽然路卡利欧在对战中占了上风，但小智企图靠著妙计一击逆转！彼此的一击都确实生效，双方都倒下了。要在合众联盟获胜的意志相互冲突！究竟胜利女神会对谁微笑呢？ .
第109集红豆杉研究所！展开新旅行
剧情图片 结束合众联盟挑战的小智一行人，前往鹿子镇拜访红豆杉博士。他们在路途中遇见了新人训练家诺诺美，她因为个性慎重小心，所以很犹豫要不要过石桥，慌乱地僵在路中央。小智他们鼓励诺诺美前进後，直接前往研究所。像红豆杉博士报告完合众联盟的成果後，小智一行人决定回到关都地方。这时候诺诺美来到了研究所！左思右想之後，诺诺美决定第一只神奇宝贝要选「火猪神奇宝贝」暖暖猪，并且要与小智合作进行对战天桐 \u0026 艾莉丝的双打对战！就在诺诺美开始享受对战乐趣的时候，突然有机械在他们面前冒出来！感觉似曾相识的三人组，到底是谁…！？
第110集
剧情图片 小智一行人初次遇到N
第111集阿克罗玛VS帅哥！电浆团的阴谋
剧情图片 小智到达了据闻建立了新道馆的桧扇市，而这间新道馆竟然与神奇宝贝训练家学校合二为一！不过兼任老师的道馆训练家黑连只是刚刚取得资格，而且道馆还未准备好。另一方面，牙牙和皮卡丘走进了广播室，不小心让全学校的广播器发出刺耳的声音，更令神宝之家的神奇宝贝们逃了出来！小智、艾莉丝和天桐分头寻找走失了的神奇宝贝，究竟会发生什么事？接着，小智的水水濑和黑连的忠犬神奇宝贝哈约克对战，最后谁胜谁负？
第112集阿克罗玛VS帅哥！电浆团的阴谋
剧情图片 电浆团的科学家阿克罗玛，正在使用神奇宝贝进行实验。他用神秘电波照射电蜘蛛，想借此引发出它的潜在能力。冻原熊也成为实验品，被放进机器内测试，究竟阿克罗玛有甚么目的？小智他们刚来到算木镇，就被眼神奇怪的暴露菇袭击！他们听说最近山上的神奇宝贝经常攻击人类，而且在高处的天文台有奇怪的人出没，于是决定前往那里调查。途中，皮卡丘、牙牙和其他野生神奇宝贝突然攻击他们！幸好得到一个登山者帮助才脱险，这个登山者的真正身份是…？
第113集雾之算木牧场！电龙的灯光!!
剧情图片 来到算木牧场的小智，遇上了少女艾莉，灯光神奇宝贝电龙和绵毛神奇宝贝咩利羊。电龙平常的工作是照顾咩利羊，但咩利羊却经常不听电龙的话。艾莉认为如果电龙学会“雷光掌”的话，就会得到认同。于是艾莉丝指派快龙作为电龙的教练，一起练习雷光掌。此时，艾莉突然发现有一只咩利羊消失了，过了一会又再有一只消失！爷爷认为应该有比电龙更加适合照顾咩利羊的神奇宝贝。当他们四出寻找咩利羊时，幕后黑手原来是……
第114集N再度登场！救出勇士鹰作战
剧情图片 企图征服世界的电浆团，在暗中继续实行计划。电浆团团员正在运送“勇猛神奇宝贝”勇士鹰，用作实验的有机素体，N为了拯救身体虚弱的勇士鹰，潜入了电浆团的货车内，可惜他被团员发现，受到猫鼬斩和饭匙蛇的猛烈攻击，掉了下山崖。小智发现了受伤的N和勇士鹰，并带他们到神奇宝贝中心治疗。不过电浆团团员凭著勇士鹰身上的发信器，找到了它所在的地点，然后截断神奇宝贝中心的电源进行偷袭。此时N向小智作出一个请求……
第115集紧急出动！神奇宝贝海岸救援队
剧情图片 小智他们来到立涌市，在看见浓烟赶到现场的时候，发现神奇宝贝海岸救援队正进行训练。他们的成员有队长弘人、“警戒神奇宝贝”步哨鼠、“飘浮神奇宝贝”轻飘飘和“修行神奇宝贝”双刃丸。当中，步哨鼠希望担当监视以外的工作，为救援队出一分力。此时，立涌联合工业区发生了意外！弘人虽然立即赶到现场救援，却意外被困在地下室内！虽然N说过“不喜欢让神奇宝贝参与危险的救援工作”，但他决定向正在外面监视的步哨鼠借用它的“感应器能力”！
剧情图片 小智他们来到介绍关都地方的“关都博览会”。在舞台上，“蜥神奇宝贝”小火龙活泼地跟观众打招呼，令小智回想起自己的“火焰神奇宝贝”喷火龙，并请大木博士把它传送过来。喷火龙曾经跟小智一起旅行，是他最强的拍档。当小智和艾莉丝的神奇宝贝一起跟喷火龙打招呼的时候，其中一只神奇宝贝跟喷火龙怒目相向…原来快龙跟喷火龙互相感觉到对方都是强者，希望一分高下，对战即将开始！
第117集电浆团的野心！被操纵的神奇宝贝
剧情图片 小智一行人和N来到了下一个城镇，而电浆团和科学家阿克罗玛碰巧正在那城镇进行以奇怪机器操纵神奇宝贝的实验。“颚斧神奇宝贝”双斧战龙受到机器发出的电波影响，开始四周破坏，城镇亦被暂时封锁。艾莉丝认为龙系神奇宝贝本性善良，应该是受到其他东西影响才会失控，于是不理劝告潜入城镇之中。她虽然派出快龙阻止双斧战龙，但连快龙也突然失控起来……N说他听不到两位“朋友”的声音，认为它们继续失控的话，身体会承受不住。于是他站在快龙和双斧战龙前面，希望能够阻止它们，却完全没有效果……
第118集N的秘密…在雾的远方！
剧情图片 浓雾消失后，两位分别叫荷莲娜和巴贝娜的小姐、“包容神奇宝贝”沙奈朵和“天体神奇宝贝”哥德小姐出现在小智他们的眼前。N在在泉水浸泡后，伤口逐渐康复，但荷莲娜和巴贝娜对人类存有警戒心。他们身处N的隐居之地，并让受过人类伤害的神奇宝贝在那里调养和生活。然后，N告诉了他们自己和电浆团的瓜葛，小智终于得悉N和电浆团的关系……突然，电浆团找到了他们所在的地方并发动攻击！荷莲娜和巴贝娜怀疑小智他们是入侵者的同伴…龙头地鼠和皮卡丘等神奇宝贝为了保护N一行人，奋力迎战，究竟会有甚么结果？
第119集火箭队对电浆团！喵喵与阿克罗玛
剧情图片 火箭队与电浆团正面对决，当电浆团的成员追赶武藏和小次郎的时候，喵喵进入基地并邀请科学家阿克罗玛加入火箭队。阿克罗玛以喵喵作为实验的有机素体作为交换条件，喵喵答应并立刻进行实验，被装置的电波照射。火箭队认为喵喵经过无数训练，绝对不会受到控制，但当电波愈来愈强，喵喵的眼神突然有所改变！喵喵的攻击力全面爆发，并听从安洁的指示，开始攻击武藏和小次郎……
第120集白色遗迹！小智对N!!
剧情图片 小智一行人，到达了遗迹附近的龙螺旋之塔，并由红豆杉博士父亲的助手迎接他们到遗迹。博士和小智他们进入了白之遗迹，并发现了据称由传说的神奇宝贝莱希拉姆变身而成的光芒石。在博士拿起光芒石的时候，它突然发出强烈的光芒！而N亦出现在遗迹，并问博士会怎样对待光芒石。听到博士的答案后，N二话不说把光芒石抢走了！然后电浆团也来到遗迹，究竟事情会怎样发展？
第121集电浆团袭击！复活的仪式!!
剧情图片 被困在遗迹的N和小智对神奇宝贝有不同的想法。N听到遗迹外神奇宝贝的呼唤后变得焦急，想尽快离开地底遗迹。小智则和神奇宝贝们同心协力，为寻找出口不断挖掘。另一方法，艾莉丝的快龙和天桐的岩殿居蟹顽抗电浆团的攻击，可惜被阿克罗玛的神奇宝贝控制机阻止，红豆杉博士、艾莉丝和天桐也被电浆团捉住。火箭队则隔岸观火，等待机会。小智和N终于逃出地底遗迹，但是皮卡丘被机器控制了！最后，电浆团的总帅，魁奇思终于开始了复活莱希拉姆的仪式。
第122集雷希拉姆对N！理想和真实的那一方
剧情图片 荷莲娜和巴贝娜为了保护N，出现在遗迹并以哥德小姐和沙奈朵阻止电浆团行动。不过，她们立刻受到控制机的电波攻击！被称为传说的神奇宝贝雷希拉姆终于复活，而且脸上充满愤怒的表情。然而，阿克罗玛遵从魁奇思的指示，成功控制了雷希拉姆，并以十字交叉火焰四处破坏。混乱中，阿克罗玛又再次用电波瞄准反抗的皮卡丘，幸好和国际警察帅哥合作的火箭队及时出现相助！然而，皮卡丘最后仍然被控制机的电波击中，究竟会有甚么结果？！奇迹会否出现？！
第123集再见了合众！新的乘船之旅!!
剧情图片 跟电浆团决战过后，小智他们回到红豆杉博士的研究所稍作休息。小智决定回去关都地方，而艾莉丝为了认识更多龙系神奇宝贝，天桐为了增广见闻，两人都决定跟小智一起前往关都地方。他们听从红豆杉博士的提议，决定坐船，经杰可罗拉群岛前往关都地方。他们乘的船与想像中的不同，虽然有点残旧但充满神奇宝贝的设备。当皮卡丘和牙牙去到神奇宝贝的游乐场，小智他们来到客房后，两间房间的门都突然被锁起来了！究竟是谁设下的阴谋呢？！
第124集香甜的三蜂蜜总是带着危险！
剧情图片 在杰可罗拉群岛旅行的小智一行，到达了三蜂蜜岛。在岛上，由三蜜蜂收集的“三蜂蜜”制成的甜品十分出名。小智一行在上岸后参加抽奖，抽中了任食一百五十一种三蜂蜜甜品的特别奖！他们和旅游发展局的职员立即前往三蜂蜜甜品工场，但原来那些职员是由火箭兵团假扮的！皮卡丘用十万伏特对抗滚滚蝙蝠和哭哭面具的攻击，却击中了一棵充满铁壳昆的树，而且它们更进化成双手均是毒针的大针蜂！比卡超、牙牙和水水獭在逃走的时候跟小智他们失散了，而且还遇上喵喵…
第125集酒侍侦探天桐！大海上的密室!!
剧情图片 小智他们决定参加船上举行的“海洋杯锦标赛”，大会完结之后会举行宝石收藏家莉普儿的展览会。小智他们在船上认识了莉普儿，并到她的房间观赏她最重视的宝石“酷豹之瞳”。另一位宝石收藏家常卢，要求莉普儿出让“酷豹之瞳”被拒，原因是常卢拒绝让其他人观赏自己的收藏品。在大会完结之后，莉普儿发现“酷豹之瞳”消失了！明明房间是密室，外面又有步哨鼠监视，究竟是谁，用甚么方法偷走宝石？！此时，酒侍侦探天桐登场！
第126集再见了水水獭!? 迈向扇贝贝王之路！
剧情图片 小智一行到达了即将举行扇贝贝王争夺战的扇贝贝岛。扇贝贝王争夺战的胜利者，除了可以得到扇贝贝王的称号和金扇贝贝作奖品，还能够跟扇贝贝女王“水水可”成为情侣！水水獭对水水可一见钟情，誓要得到胜利。比赛中，参赛者要比拼扇贝贝的形状和颜色，又要用扇贝贝打碎瓦片等等。除了强敌双刃丸“卡瓦多罗”，还有一只外貌有点奇怪，但拥有超强扇贝贝的“双刃喵丸”。赌上扇贝贝王宝座和水水可，男人之间的真正决战，究竟最后谁胜谁负？！
第127集幻影之岛！浓雾之中的索罗亚克!!
剧情图片 小智一行前往马赫拉本岛的途中，在充满浓雾的海域中看到一个十分巨大，应该是属于神奇宝贝的影子。他们在马赫拉本岛打听到，传闻在相邻的小岛曾经出现过巨大神奇宝贝，于是他们立即前往该小岛。突然，小岛的森林里突然出现了一只巨大的食蚁炉！连皮卡丘的攻击也对食蚁炉完全没有效果。食蚁炉的攻击使森林燃烧起来，野生的神奇宝贝都慌忙逃生，牙牙在途中被受惊的宝贝球菇攻击，陷入了昏睡状态。幸好小智他们找到了一间外表残旧的神奇宝贝中心让牙牙接受治疗，但里面的乔伊小姐和差不多娃娃有点奇怪……
第128集洛托姆VS大木博士！
剧情图片 小智一行为了会合神奇宝贝研究专家大木博士，来到以“电浆神奇宝贝”洛托姆闻名的洛托姆岛。博士为了写有关“洛托姆改变型态”的论文，希望能够在这个岛收服洛托姆。他们在洛托姆专用的游乐场遇到三只洛托姆，并希望以电系神奇宝贝的电力吸引它们。除了皮卡丘外，天桐的泥巴鱼和艾莉丝的导电飞鼠也一起帮忙。原来电力也有分好吃难吃之分，究竟三只神奇宝贝的电力分别是甚么味道呢？然而，洛托姆们突然改变型态，火箭队又从中捣乱，究竟大木博士最后能否成功收服洛托姆？
第129集杰可罗拉群岛的海贼王！
剧情图片 火箭队从杰可罗拉轮船的食物仓库偷取高级的食材，却被突然出现的蓝鳄、章鱼桶和玛力露丽全部抢走。小智一行人听到警报声，知道有海贼出现后，为了阻止它们追到甲板。但是它们会合了在海上接应的鸭宝宝，坐着木筏成功逃走。小智唯有派出喷火龙跟踪，希望找出它们的基地。上岸后，小智他们从君莎口中得悉那几只神奇宝贝是作恶多端的神奇宝贝海贼团。他们跟着喷火龙的指示，找到海贼团的基地，并得悉它们成为海贼的原因。然而，海贼团不理会他们的劝告，最后唯有以对战一分高下……
第130集小智和巴大蝶！总有一天再见面!!
剧情图片 到迁徙岛的小智一行人，遇见一群铁甲蛹一起进化成巴大蝴，十分感动。这个岛是首席天鹅等等会迁徙的神奇宝贝，必定会途经的中途站。小智遇上一只赶不上进化的绿毛虫，回想起昔日跟自己一起旅行的绿毛虫，于是决定协助它尽快进化。虽然他们立即开始特训，但绿毛虫总是在途中睡着，令小智他们非常着急。特训途中，他们不小心闯进了圈圈熊的地盘，被圈圈熊追赶时，绿毛虫挺身而出保护小智！究竟结果会怎样呢？
第131集小智与艾莉丝绝交!? 离别的直路
剧情图片 小智一行人来到杰可罗拉群岛中最大的岛屿大岛，他们决定经横越大岛的大直路，走到大岛的另一面。他们在途中遇见罕见的神奇宝贝土龙弟弟，当小智想收服它的时候，被它的噪音攻击反击。受到噪音影响，小智不小心踏碎了艾莉丝的花饰，牙牙亦不小心阻碍了皮卡丘出绝招，让土龙弟弟趁机逃走，小智和艾莉丝因此吵起来。小智为了修复关系摘果实给艾莉丝吃，却因摘了难吃的果实而产生反效果，令愤怒的艾莉丝要跟小智绝交！
第132集向基拉祈许愿吧！七日的奇迹!!
剧情图片 小智一行人继续在大岛旅行，在某个夜晚，遇见一千年只会苏醒七天的“许愿神奇宝贝”基拉祈。在皮卡丘和牙牙跟基拉祈玩耍的时候，小智出现并吓走了害怕人类的基拉祈。少女何莉听到小智他们遇到基拉祈，追问基拉祈的下落。何莉希望基拉祈令这座山回复以往山明水秀的环境。小智他们和何莉搜索了七天，基拉祈终于出现，不过火箭队从中破坏，并捉走基拉祈。究竟何莉的愿望最后能否实现？！
第133集光之飞碟！大宇怪之城!!
剧情图片 小智一行人在大岛的神奇宝贝中心留宿，醒来后，小智发现皮卡丘、天桐、艾莉丝和艾莉丝的都变成“脑神奇宝贝”大宇怪的样貌。小智大吓一跳，去找乔伊小姐和乔伊的求救，但连她们都变了大宇怪，连君莎和其他居民都无一幸免！小智为了避开其他人的视线躲进小巷，并遇到躲在地下水道，正在寻找喵喵的武藏和小次郎。小智迫不得已和火箭队合作，究竟大宇怪有甚么可怕的阴谋?!
第134集三色堇登场！发电蜥与指路羊!!
剧情图片 小智一行来到果实岛，为了庆祝果实收成，果实岛正要举行一个盛大的祭典。他们途中遇到神奇宝贝记者三色堇。三色堇带著指路羊和发电蜥，从卡洛斯地方来到果实岛取材，她想为在祭典举行的神奇宝贝相扑大会写一篇报导。相扑大会的冠军奖品是“振奋精神的头布”和大量树果，小智与炒炒猪、天桐与花椰猴、艾莉丝与快龙都决定参赛，究竟他们会遇上怎样的强敌？
第135集宝藏之谜！无人岛大冒险！
剧情图片 小智一行来到椰子岛，他们听三色堇说附近的无人岛埋藏着一个与神奇宝贝有关的传说宝藏。神奇宝贝记者三色堇曾经去过一间海盗博物馆取材，并在调查后发现了宝藏的地图和暗号。火箭队偷听到小智他们的对话后决定抢先一步，到无人岛抢走宝藏。小智他们来到无人岛后不断受到不同的神奇宝贝袭击，而这些申请表都有一个共通点…究竟他们最后能否成功发现宝藏！？
第136集小椿与艾莉丝！颜色不同的赤面龙
剧情图片 小小智一行为了与生活在洞穴的神奇宝贝见面，在洞窟岛下船，并在那里偶然重遇小椿。小椿来洞窟岛是为了收服“颜色不同的赤面龙”，但在遇中与快龙走失了，于是小智他们帮忙寻找快龙。虽然成功找回小椿的快龙，但她却与艾莉丝的快龙争吵起来。最后，他们为了寻找颜色不同的赤面龙，向森林深处的洞穴进发，可是…
第137集音波飞龙登场！彗星与勇者的传说!!
剧情图片 小智一行人来到杰可罗拉群岛中某一个岛，他们为了观察“乌地多彗星”，和三色堇一起前往山顶。据说彗星出现的时候，神奇宝贝会聚集在山上，并会有不可思议的行动。他们到达山顶之后，发现了勇者乌地多曾经在此展开无数战斗的对战区遗迹。他们在阴暗的通道前进，而火箭队早已在前面埋伏……
第138集前进吧！指路羊！
剧情图片 小智一行人和神奇宝贝记者三色堇，来到某个岛上的神奇宝贝中心。因为三色堇要整理采访材料，小智他们暂时代为照顾指路羊。小智对来至卡洛斯地方的指路羊十分有兴趣。此时，岛上的一个少年汤尼看见指路羊，并无意间碰到它的角。当人类碰到指路羊的角，它就能感应到此人的愿望。指路羊得悉汤尼的愿望，在小智他们波留意的情况下，让汤尼骑上背脊，向某处进发。小智他们在寻找指路羊途中，遇上了君莎和汤尼的母亲，并猜测到指路羊和汤尼的去向……
第139集导电飞鼠加入火箭队!?
剧情图片 由于要等黄昏出航的船，小智一行人在草原悠闲地野餐。可是，导电飞鼠因为被艾莉丝误会，感到不满而独自飞走。导电飞鼠滑翔的时候被强风吹至失去平衡，并在火箭队眼前坠落！它与武藏和小次郎的神奇宝贝对战，而且轻松获胜。在战斗过后，火箭队想说服导电飞鼠加入他们，幻想多多的导电飞鼠，竟然真的决定跟他们一起行动…？
第140集天桐VS冰之挑战者！三曜道馆的危机
剧情图片 小智一行人来到了岩流岛，在等待天桐的兄弟伯特和寇恩途中，出现了一只暴雪王。花椰猴和天桐之前摘了很多树果，正当花椰猴想和暴雪王分享的时候，突然受到它攻击。刚好在那个时候，伯特和寇恩来到，并告诉天桐暴雪王的训练家多拉格想要拆掉三曜道馆的招牌。伯特和寇恩已经在对战中落败，多拉格今次前来是为了击倒剩下的天桐。为了保护三曜道馆，天桐决定全力应战！
第141集祝福你们！直至再会那一天!!
剧情图片 小智一行人坐船到关都地方的港口城市·枯叶市。在杰可罗拉群岛旅行的日子也即将完结。火箭队无论如何，都想在小智他们到达关都之前捉走皮卡丘，他们用巨型的气球把客船吊起，使客船充满混乱。火箭队像平常一样抢夺小智他们的神奇宝贝，但今次帕卡先生竟然协助火箭队的恶行？
第142集我的梦想、神奇宝贝大师!!
剧情图片 小智环绕杰可罗拉群岛的旅行，在到达关都地方的枯叶市后终于告一段落。小智跟艾莉丝和天桐告别，各自向自己的梦想进发。小智和三色堇一起回到真新镇，在回家不久后立即前往大木博士的研究所，与神奇宝贝见面。小智回顾了在合众地方的冒险，决定前往卡洛斯地方，实现自己成为“神奇宝贝大师”的梦想。
第143集天桐 小刚！暴鲤龙的逆鳞!!
剧情图片 天桐告别小智和艾莉丝，和花椰猴一起来到城都地方。他在某个湖钓鱼，并钓到暴鲤龙。可惜花椰猴在和暴鲤龙的对战中落败，天桐立刻带受伤的花椰猴到神奇宝贝中心，并在那里遇上小智往日的旅伴小刚和拥有皮卡丘的女孩阿由美…
第144集艾莉丝VS小椿！通往龙系大师之路!!
剧情图片 在龙之圣地的树上睡觉时不小心掉到盔甲鸟的身上，受到惊吓的盔甲鸟带着圆陆鲨来到了城都地区，初次到城市的圆陆鲨对未见过的实物感到害怕，开始在城市里随意挖洞破坏，从而被居民追赶。以挑战烟墨道馆的馆主小桩为目标的艾莉丝认为圆陆鲨这么做一定有原因，后来艾莉丝与其心灵相通，化解了矛盾，圆陆鲨对艾莉丝也产生了好感...
[动画音乐资料来源]
• 精灵宝可梦剧场版
精灵宝可梦剧场版自1998年起以每年一部的速度上映，上映时间都在暑假期间。故事以传说中的宝可梦为主。为了故事的连贯性，每部剧场版上映的时候，小智的伙伴们与手持的宝可梦都与当时播放的电视动画保持一致，但是电视动画中的小智并不知道电影版中发生的故事。剧场版正式放映前，都会播放一段皮卡丘短片。
• 皮卡丘短片
皮卡丘短片是一系列以皮卡丘为主角的动画短片的统称，片中鲜少出现人类。这些短片有作为OVA发售的，也有在电影版正式播放之前放映，或于ANA机上放映，另外还有两部3D电影单独放映，非OVA的基本都是限定期间放映。