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方柏山，男，福建莆田人，1957年6月生于北京市。浙江大学和天津大学化学工程专业学士和博士学位。现任厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程学系生物化工研究所所长，闽江学者特聘教授。
1991.10-1993.04德国斯图加特大学生化工程研究所访问（DAAD奖学金资助）。
2000.08-2001.08德国生物技术研究中心（GBF）访问。
1983.02-1988.07华侨大学化工与生化工程系生化工程教研室，助教。
1988.07-1994.06华侨大学化工与生化工程系生化工程教研室，讲师。
1994.06-1998.07副教授（1995年起被聘为硕士生导师）。
1998.07-今教授（破格晋升，2003年起被聘为天津大学生物化工合作博导、2004年起被聘为华侨大学生物化工博士生导师）。
1984.09-1990.07华侨大学化工与生化工程系科研秘书和实验室秘书（兼）。
1993.04-1995.03华侨大学化工与生化工程系生化工程教研室副主任、主任。
1995.03-1998.06华侨大学化工与生化工程系副系主任（主持工作）。
1998.06-1999.06华侨大学化工学院常务副院长。
1999.06-2000.08华侨大学化工学院常务副院长（主持工作）。
2000.08-2001.05华侨大学化工学院常务副院长（出国）。
2002.03-2008.08华侨大学材料科学与工程学院院长、工业生物技术研究所所长、生物化工福建省重点学科学科带头人。工业生物技术福建省高校重点实验室主任。
2008.09- 今闽江学者特聘教授，厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程学系生物化工研究所所长。
主讲课程
本科：计算机在生物工程中的应用、酶工程、生物反应工程。
硕士研究生：生物反应工程、酶工程、生物信息学、生化过程模型化与控制。
博士研究生：生物化工研究进展、代谢工程等。
项目
参加国家重点基础研究发展计划（973计划）：生物炼制细胞工厂的科学基础-代谢功能的环境应答和适应机制（2007CB707804，2007.1-2011.12）。
负责国家高技术研究发展计划（863计划）项目：“生物基化学品的生物炼制技术”子课题“代谢途径中关键酶酶学性质研究” （2006AA020103，2006.12-2010.12）。
负责国家高技术研究发展计划（863计划）项目：“生物基化学品的生物炼制技术”子课题“L- 乳酸高产菌株选育” （2006AA020102，2006.12-2010.12）。
主持国家自然科学基金资助项目：丙三醇酶法连续歧化及其产物分批提纯的过程集成（20676048，2007.1-2009.12）。
主持国家自然科学基金资助项目：胞外甘油酶法歧化与其产物分离提取的过程集成（20446004，2005.1-2005.12）。
主持国家自然科学基金资助项目：1，3-丙二醇生产菌的定向酶进化及其关键酶的构效关系（20276026，2003.1-2005.12）。
主持国家自然科学基金资助项目：基于荷电膜、辅酶再生的多酶连续催化过程研究（29776025,1998.1-2000.12）（注：有关木糖生物转化生产木糖醇方面的研究）。
主持国家教委留学回国人员基金资助项目：应用神经网络于木糖醇发酵过程研究（1994-1996）。
主持福建省自然科学重点项目基金：用辅酶再生多酶催化法连续生产1，3-丙二醇和二羟基丙（D01012，2001.5-2004.5）。
主持福建省自然科学重点项目基金资助项目：木糖醇发酵与产物提纯过程研究（C96068，1996.5-1999.5）。
主持福建省科技重点项目基金资助项目：应用脱氧核糖核酸家族重排技术开发1,3-丙二醇生物法生产新菌株（2003I020，2003.5-2006.4）。
参加福建省科技重大专项：制革行业清洁生产和循环经济技术的研发（2005HZ03-3，2005.7-2008.6）。
主持福建省自然科学基金资助项目：发酵产品生产过程调优研究（1989-1991）。
主持福建省自然科学基金资助项目：木糖醇生产菌的选育（1994.5-1996.5）。
主持福建省自然科学基金资助项目：基于荷电膜、辅酶再生的多酶连续催化过程研究（F99021，1999.5-2001.5）。
主持福建省自然科学基金资助项目：1,3-丙二醇生产菌的定向酶进化及其关键酶的构效关系研究（F0310020，2003.5-2006.5）。
主持福建省教委优秀留学回国人员基金资助项目：生物微胶囊固定化酵母细胞的研究（1999-2000）（注：有关木糖生物转化生产木糖醇方面的研究）。
主持广东丽珠集团新北江制药股份有限公司有限公司委托研究项目：妥布霉素发酵工艺条件调优（2000.5-2002.4）。
为主参加福建省自然科学基金资助项目：无电荷超滤膜酶膜反应器中氧化还原酶催化过程研究（2005.5-2008.5）。
为主参加福建省自然科学基金资助项目：发酵物提纯反应与分离耦合相平衡研究（B9810011，1998-2001）。
为主参加生物反应器国家重点实验室项目：生物反应过程“软传感器”开发（1999-2001）（注：有关木糖醇发酵过程“软传感器”开发）。
著作
方柏山著，《生物技术过程模型化与控制》，暨南大学出版社，1997.12。
张嗣良，方柏山，《生物反应过程检测与控制》，化学工业出版社（待出版）。
吴松刚主编，《微生物工程》，科学出版社，2004（参加编写部分章节）。
专利
一种转化丙三醇制备乳酸的方法。
一种对辅酶和辅酶依赖性酶进行偶联固定的方法。
一种由生物催化转化甘油制备1,3-丙二醇和二羟基丙酮的方法。
生产1,3-丙二醇的微生物固定化发酵罐。
罗伊氏乳杆菌益生中空微胶囊及其制备方法。
一种新型固体酸催化剂的制备方法。
论文
方柏山，由分批培养数据估算微生物生长动力学和能学参数，生物工程学报，2⑷： 54-60,1986。
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中国微生物学会生化过程模型化与控制专业委员会常务理事、中国生化与分子生物学学会工业生化与分子生物学分会理事、福建省化工学会副理事长、福建省生化与分子生物学学会副理事长、福建省微生物学会常务理事。